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影响因子:13.263 期刊 :Plant Biotechnology Journal 合作技术:iTRAQ蛋白质组学
【研究内容】:2018年1月,华南农业大学园艺学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室发表了新成果,该研究探讨了淀粉水果“香蕉”在成熟过程中的淀粉降解机制。首先,研究者从香蕉果实中鉴定得到了38个编码淀粉降解相关蛋白的基因序列,发现在香蕉果实成熟过程中,伴随着淀粉向糖的转化过程,其中27个候选基因的水平显著升高。此外,基于iTRAQ的蛋白质组学实验鉴定了18种与淀粉颗粒表面结合的淀粉降解相关酶,其中10种在成熟过程中显著上调。另外针对MaGWD1启动子的酵母单杂交筛选到了一种转录因子bHLH,电泳迁移率分析、染色质免疫沉淀(ChIP)和瞬时表达实验证实,MabHLH6通过识别启动子中存在的E-box(CANTG)基序,激活11个淀粉降解相关基因的启动子。总之,这些发现表明香蕉果实成熟过程中的淀粉降解可能归因于转录和翻译水平上与淀粉分解相关的许多酶的复杂作用,并且MabHLH6可能通过直接激活一系列淀粉降解相关基因而作为该过程的积极调节者。
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影响因子:12.658 期刊 :Journal of Experimental & Clinical Cancer Research 合作技术:iTRAQ蛋白质组学分析
【研究内容】:2019年6月,深圳市龙岗区人民医院消化内科探讨了泛素特异性蛋白酶3 (USP3) 的异常表达对胃癌转移的影响。该研究利用iTRAQ蛋白质组学技术鉴定了USP3过表达胃癌细胞与对照细胞之间差异表达的蛋白质,发现SUZ12对于USP3介导的胃癌活性是不可或缺的,USP3结合SUZ12,去泛素化SUZ12并使其稳定。SUZ12敲除抑制USP3诱导的迁移、侵袭和EMT。临床样本检查证实USP3表达与SUZ12蛋白表达呈正相关,USP3或SUZ12蛋白水平与E-cadherin水平呈负相关。这些结果表明USP3-SUZ12信号通路促进胃癌发展。
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影响因子:12.067 期刊 :Cell Death & Differentiation 合作技术:LC-MS/MS蛋白质谱鉴定
【研究内容】:2020年5月,南方医科大学基础医学院细胞生物学教研室在期刊Cell Death & Differentiation发表新论文。该研究探讨了泛素相关蛋白样因子2 (UBAP2L)在应激颗粒(SG)动态调控中的细胞和分子机制,发现UBAP2L蛋白在SG的组装和拆卸中都是必需的。其UBAP2L的RGG (Arg-Gly-Gly)基序介导SG组分(包括mRNP、RBP和核糖体亚基等)的招募;UBAP2L的未知功能域(DUF)与G3BP1/2蛋白相互作用,其缺失导致了UBAP2L和G3BP1/2的胞质-核转运,从而影响SG的形成。蛋白质精氨酸甲基转移酶PRMT1通过靶向RGG基序使UBAP2L不对称二甲基化。精氨酸甲基化的增加抑制了UBAP2L与SG组分的相互作用,且抑制了SG的组装。这些结果为UBAP2L调节SG动力学和RNA代谢的机制提供了新的见解。
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影响因子:11.816 期刊 :JNCI J Natl Cancer Inst 合作技术:LC-MS/MS蛋白质谱鉴定
【研究内容】:2018年3月,中山大学第一附属医院的研究人员发表新研究成果,他们对胶质母细胞瘤标本及正常脑组织进行了circRNA深度测序,用Northern-blot、Sanger测序、抗体和LC-MS/MS检测证实了circ-FBXW7及其编码蛋白的存在。进一步的功能研究显示circ-FBXW7编码的小肽能抑制癌细胞的增殖和细胞周期加速,其通过拮抗USP28诱导的c-Myc稳定作用降低了c-Myc的半衰期。临床数据表明,circ-FBXW7和FBXW7-185aa对脑癌具有潜在的预后意义。
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影响因子:10.787 期刊 :Redox Biology 合作技术:iTRAQ蛋白质组学
【研究内容】:2022年8月,暨南大学的研究人员探讨了母体压力引起的胚胎骨发育不良的具体机制尚不明确。本研究证明了烷氧基自由基诱导产前骨生长迟缓和软骨细胞凋亡的相关信号通路:烷氧基自由基通过胚胎中铁介导的芬顿反应导致软骨细胞中氧化磷脂的显著积累,此外脂质过氧化终产物4-HNE的作用,它与关键的软骨形成转录因子SOX9形成加合物,导致其降解,从而抑制软骨形成。
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影响因子:10.183 期刊 :Mol Ther Nucleic Acids 合作技术:SILAC标记定量蛋白组学、免疫共沉淀Co-IP MS
【研究内容】:2019年6月,暨南大学医学院费嘉教授团队通过基因芯片和SILAC蛋白组学等方法联合分析,发现PPFIA1是miR-181a的直接靶基因。当敲低细胞中的PPFIA1后,KIT信号分子的磷酸化水平明显下调。另外,CoIP-MS实验发现,PARP1会结合PPFIA1,并通过激活核受体kappa B(NF-kB)-P65的表达而上调KIT蛋白;抑制PPFIA1或PARP1能够下调c-KIT水平,抑制CML细胞生长,并延长小鼠存活期。总的来说,该研究揭示了miR-181a/PPFIA1/PARP1/NFkB-P65/KIT的分子调节轴,并提出PPFIA1和PARP1可能是潜在的CML治疗靶点。
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影响因子:9.685 期刊 :Cell Death & Disease 合作技术:iTRAQ蛋白质组学
【研究内容】2021年8月,广州中医药大学的研究人员利用脂质组学和转录组学技术发现,高脂肪饮食不仅增加了CRC小鼠模型的肿瘤重量,还增加了棕榈酸水平和TLR4表达。棕榈酸通过PU.1蛋白调控TLR4的表达。iTRAQ蛋白质组学数据显示,TLR4敲低改变了肿瘤组织中的代谢酶谱,从而完全消除了高脂肪饮食对ATP产生和肿瘤生长的促进作用。
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影响因子:8.756 期刊 :Oncogene 合作技术:LC-MS/MS蛋白质谱鉴定
【研究内容】:2020年8月,中山大学肿瘤防治中心的研究人员在Oncogene期刊发表新成果,发现LINC01503在NPC中高表达并与不良预后有关,在体外促进NPC细胞的增殖,迁移和侵袭,在体内促进肿瘤的生长和转移。LINC01503募集了富含脯氨酸和谷氨酰的剪接因子胺(SFPQ)来激活Fos like 1(FOSL1)转录,而FOSL1的过表达逆转了LINC01503敲低对NPC进展的抑制作用。此外,雄激素受体(AR)介导的转录激活是NPC细胞中LINC01503过表达以及AR配体依赖性细胞生长、迁移和侵袭的原因。这些发现表明,AR诱导的LINC01503可以通过SFPQ-FOSL1通路促进NPC发展,或成为新的NPC预后标志物和治疗靶标。
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影响因子:7.449 期刊 :Molecular Oncology 合作技术:LC-MS/MS质谱鉴定
【研究内容】:2023年1月,中山大学肿瘤防治中心的研究人员通过RNA pull down实验筛选并验证了LINC00173的互作蛋白RAB1B,阐明了LINC00173通过RAB1B的胞外转运功能,促进PA2G4或SDF4分泌,在体内和体外促进NPC细胞的增殖、迁移和侵袭的分子机制。
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影响因子:7.173 期刊 :Biology Direct 合作技术:LC-MS/MS质谱鉴定,蛋白质谱鉴定
【研究内容】:2023年4月,贵州医科大学临床医学系的研究人员在期刊Biology Direct上发表新成果。该论文通过体外和体内试验发现,TM4SF1的表达与肝癌的进展和干细胞性呈正相关。利用生物信息学分析和蛋白质质谱鉴定了TM4SF1的下游蛋白MYH9及其最终调控靶点NOTCH通路。此外,还利用Lenvatinib耐药细胞株检测了肿瘤干细胞与肿瘤耐药之间的关系,证明了TM4SF1可以通过上调MYH9来激活NOTCH通路,从而促进肝癌的干性和Lenvatinib耐药性。
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影响因子:5.168 期刊 :Oncotarget 合作技术:iTRAQ蛋白质组学分析、itraq
【研究内容】:2017年7月,中国农业科学院兰州兽医研究所基于iTRAQ差异蛋白质组学技术比较了蛋白质在弓形虫三种生命周期形式(卵囊、速殖子和含缓殖子的包囊)中的丰度,研究结果揭示了这种寄生虫在三个生活周期阶段的蛋白质表达的差异,为了解这些生活周期形式对其栖息地的适应机制提供了新的见解。