结合了抗体的磁珠或树脂(Beads)与样本裂解液孵育,通过”抗原-抗体“之间的免疫作用,诱饵蛋白被吸附在Beads上,与此同时,诱饵蛋白的互作蛋白,也一起“共沉淀”到Beads上。洗涤去掉未结合的蛋白后,再用洗脱缓冲液将互作蛋白复合物从Beads上洗脱下来,得到免疫共沉淀(Co-IP)产物。Co-IP产物既可以用Western Blot检测已知蛋白,也可以用质谱鉴定未知蛋白。
当没有合适的诱饵蛋白抗体时,还可以通过表达融合了Flag标签的诱饵蛋白,利用Flag标签抗体做免疫沉淀。即样本过表达Flag-Bait,经裂解后与anti-Flag珠子孵育,诱饵融合蛋白与Beads结合,其互作蛋白“共沉淀”到Beads上,再经洗涤、洗脱后,用WB或质谱检测。
辉骏生物10年科研服务经验,专业提供分子互作实验服务,包括蛋白与蛋白、蛋白与DNA、蛋白与RNA、RNA与RNA的相互作用技术,经验丰富,实验结果稳定、可靠。
我公司自有分子、细胞和质谱实验平台,能执行最优的实验路线,对微量互作蛋白的质谱鉴定有充足把控力,对后续功能分析有独到见解。
我们不仅会提供专业的售前方案建议、而且售后技术支持将一直保持到文章发表,确保您安心进行下游实验及投稿。
目前,客户已在Nature子刊、Oncogene、Cell Research等高水平期刊成功发表大量高分文章(点击查看客户文献)。
内源蛋白抗体免疫共沉淀CoIP实验步骤
标签抗体免疫共沉淀CoIP实验流程
蛋白质之间相互作用是其发挥生物学功能的主要模式,蛋白质会通过结合不同的伙伴来行驶不同的功能,形成复杂的信号转导网络。常见的蛋白互作研究方法主要有:免疫共沉淀(Co-IP)、pull down、酵母双杂交、荧光双分子互补(BiFC)、荧光共定位等。这些方法相互补充,通过多种方法共同验证蛋白质间的相互作用,能更大程度的避免假阳性结果。
Co-IP技术采用抗体捕获样本中的目标蛋白及其互作蛋白复合物,反应的是体内真实的生理结合,但不能显示这些相互作用是直接还是间接的;另外合适的免疫共沉淀抗体是决定实验成功的关键,有些蛋白没有合适的IP抗体,无法进行内源性Co-IP实验;通过构建带标签的表达载体,使目标蛋白与标签融合表达,再借助标签抗体即可完成Co-IP实验,但需要注意合适的转基因方法又是影响该方法成功的关键。
pull down技术将目标蛋白进行体外原核表达,使标签蛋白(GST或His等)与目标蛋白融合表达,借助标签的亲和介质将目标蛋白纯化出来,可以不受抗体、物种限制,比较轻松的获得目标蛋白的结合蛋白,还可以通过外源同时表达目标蛋白和待测蛋白,确定它们是否发生直接的相互作用,但该方法无法得知体内真实的结合情况。
酵母双杂交技术是比较古老的一种技术,将目标蛋白和待测蛋白与GAL4 的两个结构域BD和AD融合表达,在酵母细胞中,2个蛋白的结合使得BD和AD在空间上靠近,从而激活报告基因lacZ的表达。但是由于受试蛋白都需要和 AD/BD 结构域形成融合蛋白,空间构象可能改变;另外假阳性率也比较高。
荧光双分子互补(BiFC)技术将目标蛋白和待测蛋白分别与GFP的两个片段融合表达,转染细胞后,2个蛋白的结合使得GFP两个片段空间上靠近,从而发出绿色荧光,该技术观测直观,操作简便,但空间分辨率大约 250nm,对于蛋白质相互作用来说依然是个相当远的距离,因此位置上靠近但并未结合的蛋白也可能显示阳性结果,假阳性率较高;另外该技术可以验证蛋白间的相互作用,但不能筛选未知互作蛋白。
荧光共定位技术依靠荧光确定蛋白质具有相同定位,用于辅助证明而非直接证明细胞内蛋白间的相互作用。
服务项目 | 服务内容 | 结果交付 | 实验周期 | 客户提供 | 价格 |
Co-IP WB (验证型) | 样本质检 (Western blot检测诱饵蛋白和待测蛋白) | 样本的诱饵蛋白Western blot检测图 样本的待测蛋白Western blot检测图 | 3-4周 | 实验样本 诱饵蛋白的IP级抗体 待测蛋白抗体 实验信息表 | |
Co-IP调取诱饵蛋白及其互作蛋白 (2组:实验组、对照组) | IP产物的诱饵蛋白Western blot检测图 IP产物的待测蛋白Western blot检测图 CoIP实验报告 | ||||
Co-IP MS (筛选型) | 样本质检(Western blot检测诱饵蛋白) | 样本的诱饵蛋白Western blot检测图 | 6-7周 | 实验样本 诱饵蛋白的IP级抗体 实验信息表 | |
Co-IP调取诱饵蛋白及其互作蛋白 (2组:实验组、对照组) | IP产物的诱饵蛋白Western blot检测图 CoIP实验服务报告 | ||||
IP产物的质谱检测及数据分析 | 质谱(LC-MS/MS)检测结果及报告 互作蛋白筛选表格 生物信息学分析结果和报告 |
样本类型 | COIP-WB 建议送样量 | COIP-MS 建议送样量 |
动物细胞 | 3*10e7个细胞/组(约3个10cm皿) | 5*10e7个细胞/组(约5个10cm皿) |
动物组织 | 1g/组 | 2g/组 |
植物叶片 | 2g/组 | 4g/组 |
植物根或果实 | 4g/组 | 8g/组 |
菌体 | 50ul菌体沉淀/组 | 100ul菌体沉淀/组 |
▲注意:这里列出的均为每组样本的送样量,如果实验和对照组用的样本一致,此样本量*2。详细送样指南可联系辉骏生物客服或销售索取。
保存及运输:-80℃保存,干冰取样/运输,至少在送样前2天通知我司。
Co-IP WB:诱饵蛋白和待测蛋白Western blot检测图(阳性)
Co-IP MS:诱饵蛋白Western blot检测图
Co-IP MS:质谱检索表格(部分展示)
Co-IP MS:互作蛋白生信分析结果(部分展示)
Jiang S.Y. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP.
Cancer Research. 2019. (中科院1区,IF=13.312).
转移性前列腺癌具有很高的致命性。已有报道表明,胆固醇与前列腺癌的发展有关;前期研究发现,胆固醇可以诱导前列腺癌细胞发生上皮-间质转化(EMT),但其作用及潜在机制尚不清楚。本研究证明胆固醇介导APMAP上调,APMAP通过与EGFR竞争结合EPS15R,进而抑制EGFR降解,激活ERK1/2通路,促进前列腺癌细胞EMT;提出APMAP可能是一种关键的调节剂,为高脂肪饮食、肥胖和癌症转移之间提供了联系。
1. Li H.B. et al: The plant ESCRT component FREE1 shuttles to the nucleus to attenuate abscisic acid signaling. Nature Plants. 2019,IF=17.352. |
2. Jiang, S. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP. Cancer Research.2019,IF= 13.312. |
3. Huang C.Y. et al: UBAP2L arginine methylation by PRMT1 modulates stress granule assembly. Cell Death Differ. 2020 , IF=12.067. |
1. Co-IP WB,用于检测某样本中的诱饵蛋白和待测蛋白是否存在相互作用;
2. Co-IP MS,用于筛选某样本中的诱饵蛋白与哪些蛋白具有相互作用。
Co-IP(免疫共沉淀)检测服务 | |||||
服务项目 | 服务内容 | 结果交付 | 实验周期 | 客户提供 | 价格 |
Co-IP WB | Western blot检测样本(input)中的诱饵蛋白和待测蛋白 | Western blot检测图 | 3-4周 | 1、实验样本 2、诱饵蛋白的IP级抗体 3、待测蛋白抗体 4、实验信息表(样本信息、抗体信息、诱饵蛋白和待测蛋白序列) | |
Co-IP调取诱饵蛋白及其互作蛋白 (2组:实验组、对照组) | CoIP实验报告 | ||||
Western blot检测Co-IP产物中的诱饵蛋白和待测蛋白 | Western blot检测图 | ||||
Co-IP MS | Western blot检测样本(input)中的诱饵蛋白 | Western blot检测图 | 5-6周 | 1、实验样本 2、诱饵蛋白的IP级抗体 3、实验信息表(样本信息、抗体信息、诱饵蛋白序列) | |
Co-IP调取诱饵蛋白及其互作蛋白 (2组:实验组、对照组) | CoIP实验服务报告 | ||||
Western blot检测Co-IP产物中的诱饵蛋白 | Western blot检测图 | ||||
LC-MS/MS定性检测Co-IP产物的蛋白、筛选实验组独有蛋白(潜在互作蛋白) | 质谱检索表格、互作蛋白筛选表格、检测报告 | ||||
针对互作蛋白做生物信息学分析(GO、KEGG pathway、String) | 生物信息学分析结果和报告 | 1周 |
1. 送样量要求
样本类型 | Co-IP WB 建议送样量 | Co-IP MS 建议送样量 |
动物细胞 | 3*10e7个细胞/组(约3个10cm皿) | 5*10e7个细胞/组(约5个10cm皿) |
动物组织 | 1g/组 | 2g/组 |
植物叶片 | 2g/组 | 4g/组 |
植物根或果实 | 4g/组 | 8g/组 |
菌体 | 50ul菌体沉淀/组 | 100ul菌体沉淀/组 |
▲注意:这里列出的均为每组样本的送样量,如果实验和对照组用的样本一致,此样本量*2。详细送样指南可联系辉骏生物客服或销售索取。
(1)样本用PBS清洗干净后,离心去掉液体,先放入液氮中速冻,再转移至-80℃冰箱中保存;
(2)样本一定要做好标记,应用油性防冻记号笔或标签纸在管上注明样本名称或编号;
(3)样本较多或需要分批做,要将样本分装;
(4)干冰取样/运输;需要至少在送样前一天通知我方。
Co-IP WB:诱饵蛋白和待测蛋白Western blot检测图(阳性)
Co-IP MS:诱饵蛋白Western blot检测图
Co-IP MS:质谱检索表格(部分展示)
1. Li H.B. et al: The plant ESCRT component FREE1 shuttles to the nucleus to attenuate abscisic acid signaling. Nature Plants. 2019,IF=17.352. |
2. Jiang, S. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP. Cancer Research.2019,IF= 13.312. |
3. Huang C.Y. et al: UBAP2L arginine methylation by PRMT1 modulates stress granule assembly. Cell Death Differ. 2020 , IF=12.067. |
4899+客户已添加微信获取实验优惠!
名称 | 货号 | 规格 | 货期 | 价格 |
动物Co-IP试剂盒(protein A/G磁珠) | FI8802 | 20次/40次 | 现货 | |
动物Co-IP试剂盒(protein G树脂) | FI8803 | 20次/40次 | 现货 | |
植物Co-IP试剂盒(protein A/G磁珠) | FI8812 | 20次/40次 | 现货 | |
植物Co-IP试剂盒(protein G树脂) | FI8813 | 20次/40次 | 现货 |
辉骏生物的免疫共沉淀试剂盒能够高效完成抗原的免疫沉淀(IP)及免疫共沉淀(Co-IP)实验。首先,将特异性的抗体加入样品中与目标抗原形成免疫复合物,然后将其结合在protein G或protein A/G beads上。通过漂洗去除未结合物质后,用低 pH 的洗脱液将免疫复合物从beads上洗脱下来。洗脱的蛋白产物既可以用Western blot检测已知蛋白,也可以用质谱(LC-MS/MS)鉴定未知蛋白。
蛋白-蛋白间的相互作用是蛋白质发挥生物学功能的主要模式。CO-IP试剂盒采用Protein G或Protein A/G beads来捕获目标蛋白抗体,进而捕获样本中天然结合的目标蛋白及其互作蛋白。以下列举了可应用CO-IP试剂盒的几个研究方向:
1. 病毒、细菌等病原体侵染宿主细胞的机制;
2. 酶和底物的作用机制;
3. 天然状态下蛋白调控复合体的研究。
试剂名称 | 体积(20 Tests) | 体积(40 Tests) | 保存条件 |
Protein G beads或Protein A/G beads | 850 μL | 1.7 mL | 4 ℃ |
裂解缓冲液 | 11 mL | 22 mL | 4 ℃ |
漂洗液 | 40 mL | 80 mL | 4 ℃ |
洗脱缓冲液 | 1.1 mL | 2.2 mL | 4 ℃ |
蛋白酶抑制剂 | 300 μL | 600 μL | -20 ℃ |
2、裂解效率高:不同优化的裂解液配方分别适用于动物、植物样本。
3、洗脱液适配后续Western Blot及质谱(LC-MS/MS)实验。
4、操作简便,耗时短,适用于初学者。
5、应用灵活:可用于任何内源性目标蛋白的免疫沉淀或免疫共沉淀实验。
1. 将细胞裂解液与所选抗体在室温下孵育 1-2 小时,或 4 ℃ 过夜。
2. 在室温下,将抗原/抗体复合物与protein G或ProteinA/G beads结合 1-2 小时。
3. 漂洗、洗脱得到目标蛋白及其互作蛋白复合物。
1. Jiang, S. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP. Cancer Research. 2019. IF= 13.312.
2. Huang C.Y. et al: UBAP2L arginine methylation by PRMT1 modulates stress granule assembly. Cell Death Differ. 2020. IF=12.067.
3. Li T. et al: Phosphorylated ATF1 at Thr184 promotes metastasis and regulates MMP2 expression in gastric cancer. J Transl Med. 2022. IF=8.44.
上一篇:TAP-MS串联亲和纯化
下一篇:暂无
©2011-2024 广州辉骏生物科技股份有限公司 主营业务:RNA pull down DNA pull down GST pull down CoIP LC-MS/MS TAP-MS 抗体测序 版权所有 粤ICP备19156356号 | 网站地图