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服务介绍应用案例常见问答

iTRAQ蛋白质组学 * 技术原理


iTRAQ(Isobaric tag for relative and absolute quantitation)是由美国AB SCIEX公司研发的体外同重同位素标记的定量技术。该技术采用8-plex标记试剂,可以同时比较8组样本之间的蛋白表达差异。iTRAQ的8种同位素标记试剂由报告基团(113、114、115、116、117、118、119、121)和平衡基团(192、191、190、189 、188、187、186、184 )及肽反应基团组成。不同的报告基团分别与相应的平衡基团相配后,相对分子质量均为305,即等量异位标签。iTRAQ同位素试剂标记多肽氨基基团后,等量混匀多肽并进行LC-MS/MS分析。一级质谱中,不同样品来源的同一肽段表现出相同的质荷比;二级质谱中,化学键断裂释放出报告离子,低质量区的报告离子强度反映了该肽段在不同样品中的相对表达量,高质量区的肽段碎片离子质荷比反映了该肽段的序列信息。质谱原始数据经过数据库检索,即可得到样本中所含蛋白及其表达差异。




iTRAQ蛋白质组学 * 实验流程


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iTRAQ蛋白质组学 * 技术应用


基础医学:疾病标志物,发病机制,疾病分型等;

生物医药:药物机理,药效评价,药物开发等;

农林畜渔:抗逆胁迫,生长发育,耐药,致病机理等。





iTRAQ蛋白质组学 * 辉骏服务优势


1

十年服务经验,客户成果发表在NatureMethods,Oncogene,Cell Research等高水平期刊上。

2

对蛋白筛选与定量方面有独到见解,擅长针对客户情况提出合适的方案建议


3

自有分子及细胞生物实验平台,能有效制定并执行最优的实验路线。


4

售后技术支持将一直保持到客户发表文章,确保客户安心进行下游实验及投稿



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18927549347



iTRAQ蛋白质组学 * 服务信息


项目名称

客户提供

结果交付

实验周期

价格

iTRAQ

原始样本(-80℃保存,干冰运输)
样本信息表
分析要求

 1、蛋白鉴定及定量结果表
 2、肽段鉴定及定量结果表
 3、差异蛋白结果表
 4、生物信息学分析结果
 5、质谱原始数据
 6、实验报告

5-6周


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iTRAQ蛋白质组学 * 分析结果示例




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iTRAQ蛋白质组学 * 客户文献


1. Li K. et al: Tyrosine kinase Fyn promotes osteoarthritis by activating the β-catenin pathway. Ann Rheum Dis. 2018,IF=14.299.
【研究内容】:骨关节炎和软骨退变过程中,WNT/β-catenin被激活的机制尚未完全明确,本研究利用iTRAQ蛋白质组学技术,筛选了年轻(2月龄)和老龄(12月龄)小鼠的蛋白表达差异,并发现一种在老年软骨中强烈上调的蛋白——酪氨酸激酶Fyn。为了探究Fyn促进骨关节炎发展的机制,客户将免疫沉淀(IP)与蛋白质组学分析相结合,最终证明酪氨酸激酶Fyn可以通过激活β-catenin通路促进关节炎,为骨关节炎提供了一个新的治疗靶点。
使用技术:iTRAQ蛋白质组学分析、iTraq实验外包服务


2. Wu X.S. et al: Ubiquitin-specific protease 3 promotes cell migration and invasion by interacting with and deubiquitinating SUZ12 in gastric cancer. J Exp Clin Cancer Res. 2019,IF= 7.068.
【研究内容】:泛素特异性蛋白酶3 (USP3) 的异常表达可能在肿瘤发展中起重要作用,然而其促进胃癌转移的机制尚不明确。本研究利用itraq蛋白质组学技术鉴定了USP3过表达胃癌细胞与对照细胞之间差异表达的蛋白质,发现SUZ12对于USP3介导的胃癌活性是不可或缺的,USP3结合SUZ12,去泛素化SUZ12并使其稳定。SUZ12敲除抑制USP3诱导的迁移、侵袭和EMT。结果表明USP3-SUZ12信号通路促进胃癌发展。  
使用技术:itraq定量实验、itraq定量蛋白组学检测


3. Xiao Y.Y. et al: A comprehensive investigation of starch degradation process and identification of a transcriptional activator MabHLH6 during banana fruit ripening. Plant Biotechnol J. 2018,IF=6.84.
【研究内容】:本研究探讨了淀粉水果“香蕉”在成熟过程中的淀粉降解机制。研究者基于iTRAQ的蛋白质组学实验鉴定了18种与淀粉颗粒表面结合的淀粉降解相关酶,其中10种在成熟过程中显著上调。酵母单杂交、电泳迁移率分析、ChIP等实验进一步表明,香蕉果实成熟过程中的淀粉降解,可能归因于转录和翻译水平上与淀粉分解相关的许多酶的复杂作用,MabHLH6可能通过直接激活一系列淀粉降解相关基因而作为该过程的积极调节者。
使用技术:蛋白质组 iTRAQ、蛋白质组学itraq


4. Zeng L. et al: Asparagine Synthetase and Filamin A Have Different Roles in Ovarian Cancer. Front Oncol. 2019,IF=4.848.
【研究内容】:临床上早期卵巢浆液性癌较难发现,而高级别浆液性癌(HGSC)和低级别浆液性癌(LGSC)的蛋白表达谱将为诊断和化疗提供重要信息。研究者通过iTRAQ技术对13例HGSC和7例LGSC患者的标本进行了蛋白质组学分析,共鉴定出323个差异表达的蛋白质。IHC验证后,选择天冬酰胺合成酶(ASNS)和细丝蛋白A(FLNA)进行进一步的功能研究。体内和体外实验结果表明,ASNS和FLNA是HGSC和LGSC的不同的生物标志物,可能对浆液性癌的预后和临床治疗有潜在的价值。
使用技术:itraq分析、itraq差异蛋白实验





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中文标题:酪氨酸激酶Fyn通过激活β-连环蛋白途径促进骨关节炎

发表期刊:Ann Rheum dis

影响因子:14.299

发表时间:2018年