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服务介绍应用案例

PRM实验原理


PRM(平行反应监视,parallel reaction monitoring)是目前靶向定量蛋白质组学的主流方法之一。利用四级杆质量分析器选择性的检测目标肽段的母离子信息,随后在HCD碰撞池中发碎裂,最后进入高分辨率、高质量精度的Orbitrap分析器中,检测所选择的母离子窗口内的所有碎片离子信息,这样即可对复杂样本中的目标蛋白/肽段进行特异性的定量分析。





PRM技术实验流程


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蛋白组学PRM技术应用


1、验证高通量定量蛋白质组学(如iTRAQ、TMT、SILAC、Label free)的实验结果
2、对目标蛋白质相对或绝对定量分析

 





PRM蛋白定量检测*辉骏服务优势

1

十年服务经验,客户成果发表在NatureMethods,Oncogene,Cell Research等高水平期刊上。


2

对蛋白筛选与定量方面有独到见解,擅长针对客户情况提出合适的方案建议


3

自有分子及细胞生物实验平台,能有效制定并执行最优的实验路线。


4

售后技术支持将一直保持到客户发表文章,确保客户安心进行下游实验及投稿



 




PRM靶向定量实验服务信息


项目名称

客户提供

结果交付

实验周期

PRM

原始样本(干冰运输,广州地区可上门取样)

样本信息表
分析要求
 

1、全谱检测结果
2、PRM定量用目标肽段及子离子列表
3、PRM预实验结果
4、PRM正式实验结果
5、质谱原始数据
6、实验报告

5-6周




PRM靶向定量实验 客户文献


1. Lisa H.et al: Development of a Parallel Reaction Monitoring Mass Spectrometry Assay for the Detection of SARS-CoV‑2 Spike Glycoprotein and Nucleoprotein.Analytical Chemistry.2018,IF=4.402.
【研究内容】:研究者采用数据独立采集(DIA)定量质谱法对20例接受培美曲塞/铂类化疗的晚期肺腺癌患者的血清标本进行分析,并使用平行反应监测(PRM)方法检测了20例患者和22例晚期肺腺癌患者的16个候选血清标志物。研究证实了DIA、MS和PRM相结合的方法在识别晚期肺腺癌患者的血清预测生物标志物方面是有效的。
使用技术:蛋白组学prm实验检测、PRM靶向蛋白质组学服务、蛋白组 prm外包公司


2. Clara I.et al: Ethylene Receptors, CTRs and EIN2 Target Protein Identification and Quantification Through Parallel Reaction Monitoring During Tomato Fruit Ripening.Front. Plant Sci.2020,IF=6.785.
【研究内容】:研究者为乙烯受体(ETR)及其下游组分CTR和EIN2的鉴定和定量,开发了一套包括样品分离和平行反应监测结合质谱分析(PRM-MS)的研究方案。以番茄为模式果实,研究了果实成熟过程中乙烯信号转导相关蛋白丰度的变化。研究证实了鉴定和绝对定量番茄四个成熟阶段的七个乙烯受体、四分之三的CTR和EIN2的可行性。
使用技术:蛋白PRM定量技术服务、平行反应监测技术PRM、蛋白定量prm代做


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中文标题:靶向蛋白质组学在子宫内膜癌液体活检诊断中的作用

发表期刊:Clinical Cancer Res

影响因子:12.531

运用技术:PRM靶向定量蛋白质组学(由辉骏生物提供技术支持)




● 内容概述


子宫内膜癌(EC)的诊断依赖于通过抽吸获得的子宫内膜活检组织(即子宫抽吸物)中肿瘤细胞的观察,漏检率达22%,50%的EC组织分型和级别被错诊。基于这种现状,本研究意图通过液体活检检测蛋白标志物的方式得到一种更加准确的诊断方式。通过最新一代的靶向质谱采集技术LC-PRM对子宫吸出液体的52个蛋白含量进行测定,在EC组和对照组以及EC压型组运用逻辑回归模型对数据进行处理,处理结果显示MMP9和KPYM两种蛋白组合能够有效诊断EC AUC值为0.96,CTNB1、XPO2和CAPG联合检测能够有效区分各压型,AUC值为0.99。该研究为临床诊断提供了非常好的候选标志物。



● 方法流程


本研究遵循的一般工作流程如图所示。116例患者的子宫抽吸液处理一式两份,并在混合四极轨道质谱仪上进行PRM采集分析。

 

在每个样本中,先前研究(15)中优先考虑的52个候选生物标记物的相对丰度是通过对98个肽的分析来测量的。计算光谱相似性分数以确认多肽的同一性并检测MS信号中的干扰。超过50%的样本中没有检测到的五个肽被移除,导致总共有51个蛋白质被93个肽测量出来。通过重复样品制备来评价分析流程的重复性,98%的检测多肽的变异系数(CV%)低于15%,平均为3.6%。此外,来自同一蛋白质的多肽显示出高度的相关性,因此,它们可以互换使用来评估蛋白质水平。只有三种蛋白(KPYM、OSTP和ROA2)的相关系数低于0.85,因为它们是由异构体特异性多肽监测的。这些多肽被认为来自不同的蛋白质。

 

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引用文献

 

Elena Martinez-Garcia. et al: Targeted Proteomics Identifies Proteomic Signatures in Liquid Biopsies of the Endometrium to Diagnose Endometrial Cancer and Assist in the Prediction of the Optimal Surgical Treatment. Cancer Res.  2017,IF=12.531.

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