ChIP-seq 是染色质免疫沉淀测序的缩写。从根本上说，ChIP-seq 是对与正在研究的 DNA 结合蛋白共沉淀的基因组 DNA 片段进行测序。以这种方式最常研究的 DNA 结合蛋白是转录因子（例如，p53 或 NFκB）、染色质修饰酶（例如，p300、组蛋白去乙酰化酶）、与基因组 DNA 相互作用的修饰组蛋白（例如，组蛋白 3 三甲基化赖氨酸 4）和基础转录机制的组成部分（例如，RNA 聚合酶 II）。从理论上讲，该技术可以以公正的方式识别基因组中与特定 DNA 结合蛋白物理相关的所有 DNA 片段。  我们说“不偏不倚”是因为免疫沉淀中的任何 DNA 都会被测序，因此该技术不依赖于对精确 DNA 结合位点的先验知识。

辉骏生物提供的ChIP染色质免疫共沉淀服务分为以下两种：

1. ChIP qPCR，用于检测某样本中的诱饵蛋白和待测DNA片段是否结合；

2. ChIP seq，用于筛选某样本中的诱饵蛋白可以结合哪些DNA区域。