DAP-seq实验简介
DAP-seq（DNA Affinity Purification Sequencing，DNA亲和纯化测序）是在体外条件下检测目标转录因子（TF）的DNA结合位点（TFBS）的高通量测序技术。
首先，体外表达带标签的目标蛋白（转录因子），再与特异性亲和磁珠孵育，将目标蛋白结合到磁珠上。同时，提取样本中的基因组DNA并进行超声打断。之后，将结合了目标蛋白的磁珠与样本DNA片段孵育，洗杂后，提取DNA进行高通量测序，以寻找目标转录因子的结合DNA。
DAP-seq技术将转录因子与DNA的结合研究从体内转移到体外，突破了传统ChIP技术对抗体的依赖，省去了蛋白与DNA交联的繁琐步骤，适用于各物种各类型样本，尤其是植物和微生物等。
DAP-seq不仅可以批量检测多个转录因子，而且捕获的是转录因子直接结合的DNA片段。
辉骏生物DAP-seq实验外包优势
辉骏生物15年科研服务经验，专业提供分子互作实验服务，包括蛋白与蛋白、蛋白与DNA、蛋白与RNA、RNA与RNA的相互作用技术，经验丰富，实验结果稳定、可靠。
公司自有分子、细胞和蛋白实验平台，能执行最优的实验路线。
我们不仅会提供专业的售前方案建议、而且售后技术支持将一直保持到文章发表，确保您安心进行下游实验及投稿。
目前，客户已在Signal Transduction and Targeted Therapy（IF: 52.7）、Journal of Hematology & Oncology（IF: 40.4）、European Heart Journal（IF: 35.7）、Molecular Cancer（IF: 33.9）、Cell Discovery（IF: 33.5）、Nature Methods（IF: 32.1）等高水平期刊成功发表大量高分文章（点击查看客户文献）。
DAP-seq 与 ChIP-seq 的比较
| DAP-Seq | ChIP-seq |
| 实验环境 | 体外重组蛋白+基因组DNA | 细胞内染色质 |
| 目标蛋白 | 体外表达带标签的目标蛋白 | 体内表达，最好中/高表达量 |
| 样本准备 | 无需交联和解交联 | 需要交联和解交联等复杂步骤 |
| 调取方案 | 无需抗体，采用标签特异性磁珠调取，亲和力高 | 需要高质量的IP级别抗体，ChIP效果依赖抗体质量 |
| 结合DNA | 操作简单 | 步骤多，对初学者不友好 |
| 适用条件 | 不用转基因株系，适合非模式生物（很多物种没有抗体） 低表达基因或难转基因的样本 | 有IP级别抗体的蛋白，表达量较高的样本 体内生理结合状态 |
| 检测通量 | 可批量检测多个转录因子
| 单次实验只能做一个转录因子 |
DAP-seq实验服务信息
服务项目
| 服务内容 | 结果交付 | 实验周期 | 客户提供 | 价格
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DAP-seq | 目标蛋白的表达载体构建 | 质粒2ug+甘油菌1mL
载体构建报告 | 1-2周
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目标蛋白序列 目标基因质粒模板 实验样本 实验信息表
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目标蛋白的体外表达
| Western blot检测图 蛋白表达报告 | 1-2周 |
| DNA亲和纯化 | Western blot检测图 亲和纯化报告 | 2-3周 |
| 纯化DNA的测序和分析 | 测序原始数据 测序分析报告 | 5周 |
DAP seq样本要求
样本类型
| DAP-seq 建议送样量 |
| 动物细胞 | 5*10e7个细胞/组（约5个10cm皿） |
| 动物组织 | 1g/组 |
| 植物叶片 | 4g/组 |
| 革兰氏阴性细菌 | 200ul菌体沉淀/组 |
| 小型真菌 | 1g/组 |
▲注意：这里列出的均为每组样本的送样量，如果实验和对照组用的样本一致，此样本量*2。详细送样指南可联系辉骏生物客服或销售索取。
保存及运输：-80℃保存，干冰取样/运输，至少在送样前2天通知我司。
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实验热线：4006991663
