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「辉骏客户文章」Adv Sci ( IF=14.1 )|RNA pull down试剂盒助力WTAP介导的m6A修饰促食管鳞癌机制研究
发布时间:2025-08-07 14:32:37作者:辉骏生物-fitgene

2025年6月5日,皖南医学院第一附属医院朱少金教授南京医科大学附属无锡人民医院毛文君教授团队共同合作,在Advanced ScienceIF=14.1)发表了题为“WTAP  Mediated m6A Modification Stabilizes PDIA3P1 and Promotes Tumor  Progression Driven by Histone Lactylation in Esophageal Squamous Cell  Carcinoma”的研究论文

非常荣幸,辉骏生物产品生物素RNA pull down试剂盒(货号:FI8702)F2-RNA pull down试剂盒(货号:FI8701),助该研究一臂之力。

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究摘要

食管鳞状细胞癌(ESCC)是一种常见的消化道恶性肿瘤,发病率高,死亡率高。许多研究表明,长链非编码RNAlncRNAs参与了各种类型肿瘤的发展。lncRNA PDIA3P1促进ESCC的进展,但其背后的分子机制尚不清楚。

作者研究发现,lncRNA  PDIA3P1在ESCC中高度表达。它可作为miRNA海绵吸附"miR-152-3p",进而降低GLUT1(葡萄糖转运体1)的  mRNA水平;它还通过结合下游靶点HK2(己糖激酶2)来阻碍其泛素化降解,促进糖酵解。高度活跃的糖酵解产生更多乳酸,进而上调组蛋白H4K8乳酸化(H4K8la)水平,促进BMP7(靶基因骨形态发生蛋白7)的转录,从而推动肿瘤进展。此外,WTAP介导的m6A修饰通过IGF2BP1依赖性识别来增强PDIA3P1的稳定性。

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究思路

研究发现lncRNA“PDIA3P1”在ESCC组织及细胞系中高表达RNA-seq结果揭示其与糖酵解相关。

生物信息学分析了靶向PDIA3P1的5种miRNA,AGO2蛋白的RIP-qPCR实验证实miR-152-3p的富集最为显著,研究者使用辉骏生物“生物素RNA pull down试剂盒”进行miRNA pull down实验,发现PDIA3P1可以结合miR-152-3p(图1K)。

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1 PDIA3P1作为miR-152-3p的海绵调节GLUT1的表达


PDIA3P1敲低显著下调了糖酵解关键酶:GLUT1和HK2的蛋白水平,且二者是PDIA3P1的下游靶点。

机制解析发现,一方面,PDIA3P1通过竞争结合miR-152-3p,减少其对GLUT1   mRNA的降解,从而维持GLUT1的稳定性和表达水平,另一方面,PDIA3P1直接结合HK2,阻断E3泛素连接酶MARCH8对HK2的泛素化降解,提高其蛋白稳定性。这两方面共同激活了糖酵解关键节点,加速了乳酸的积累。

CUT&Tag和RNA-seq实验筛选出了H4K8la的潜在靶基因BMP7(骨形态发生蛋白7),功能验证实验发现,BMP7是PDIA3P1驱动ESCC进展的下游靶点,调控ESCC的肿瘤进展。

此前研究发现其他癌症中PDIA3P1出现了大量的m6A富集峰;SRAMP预测MeRIP-qPCR显示TCGA数据库分析、qRT-PCR实验发现PDIA3P1在ESCC中存在显著的m6A修饰,并且其表达水平与m6A甲基转移酶WTAP呈正相关。

研究者使用辉骏生物“F2-RNA pull down试剂盒”证实,PDIA3P1与WTAP之间存在直接相互作用(图2H,I),WTAP通过m6A修饰调控PDIA3P1的RNA稳定性,且m6A阅读器IGF2BP1是稳定PDIA3P1的关键因子,WTAP/IGF2BP1依赖的m6A修饰是PDIA3P1高表达的关键机制。

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图2 PDIA3P1稳定性增强源于IGF2BP1对WTAP介导的m6A修饰的识别

综上所述,研究揭示了PDIA3P1在ESCC中作为代谢-表观调控枢纽的重要功能:一方面通过ceRNA机制和蛋白互作增强糖酵解,诱导乳酸依赖的组蛋白乳酰化,促进BMP7转录;另一方面通过WTAP/IGF2BP1介导的m6A修饰维持自身稳定性和表达水平。这一发现不仅拓展了对ESCC发病机制的认识,也为靶向代谢重编程与表观修饰的联合治疗策略提供了新靶点。

使用产品:生物素RNA pull downF2-RNA pull down试剂盒(由辉骏生物提供产品和技术支持)
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产品介绍

产品信息

货号

产品名称

FI8701

F2-RNA pull down Kit专利产品

FI8702

Biotin-Labeled RNA pull down Kit

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实验服务

服务项目

服务内容

F2-RNA
pull down

制备RNA正义链和反义链探针、Western blot检测样本中的待测蛋白、RNA pull down捕获目标RNA及其结合蛋白

miRNA 

pull down qPCR

合成生物素miRNA探针、qPCR检测样本中的待测靶RNA、miRNA pull down捕获miRNA-靶RNA复合体并检测(实验组、对照组)


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服务优势

01

十年服务经验,客户成果发表在Nature Methods,Oncogene,Cell Research等高水平期刊上。

02

对围绕RNA结合蛋白开展的整体课题提供全方位指导,包括上下游实验设计和结合蛋白的多方法验证等。

03

自有蛋白质组学平台,对RNA pull down产物这类微量蛋白的质谱鉴定有十足的把控能力,对后续的生物信息分析有独到的见解。

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售后技术支持将一直保持到客户发表文章,确保客户安心进行下游实验及投稿。



辉骏生物,10年专注分子互作和蛋白研究,专业提供蛋白、核酸互作产品和技术服务。辉骏自有蛋白质检测平台,擅长互作产物等微量蛋白的质谱鉴定及生物信息分

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