质谱法代表了一种强大的技术，在生物学、化学和物理学中有着无数不同的应用，而且在临床医学甚至太空探索中也有许多不同的应用。  它用于通过根据质量和电荷分离分子离子来确定化合物的分子量。

各种类型的高特异性质谱（结合气相色谱、液相色谱和基质辅助激光解吸/电离）正越来越多地用作临床实验室的工具，也用于不同的研究环境。

蛋白质组学中的质谱鉴定实验

质谱已成为表征和测序不同蛋白质不可或缺的方法。  两种能够电离蛋白质的软电离技术的发展——电喷雾电离和基质辅助激光解吸/电离——彻底改变了通过质谱法进行的蛋白质分析。

两种基本方法用于表征蛋白质：“自上而下”策略，即通过上述软电离技术将完整蛋白质电离，然后引入质量分析仪，以及首先将蛋白质酶促消化成较小肽的第二种方法（通过使用蛋白酶和其他蛋白水解剂），然后引入质量分析仪。 

质谱法因其解决蛋白质组复杂性的能力而在蛋白质分析中得到普及。  该技术在蛋白质组学中的三个基本应用是确定蛋白质相互作用、对蛋白质表达进行分类和定位蛋白质修饰位点。

LC-MS/MS蛋白鉴定应用范围

★IP，Co-IP，Pull-down类蛋白相互作用样本（胶条或溶液）的鉴定；

★细胞器，外泌体等简单样本中的所有表达蛋白质的鉴定（全谱分析）。

LC-MS/MS蛋白鉴定服务信息-辉骏生物

临床医学中的质谱

自 1975 年以来，质谱法作为复杂系统的一部分被用于医院的呼吸气体分析，该系统由麻醉患者的呼吸气体样本组成。  然而，如果不了解该方法的某些弱点，则可能会导致严重的误解。

质谱法还可用于基因组学研究，对临床医学有潜在影响。  在这种方法的几个潜在用途中，应用通常集中在单核苷酸多态性和短串联重复的表征上。

随着代谢组学的使用，质谱法在糖尿病研究中也显示出前景，因为它可以辨别来自健康人和 2 型糖尿病的不同代谢物的特定血清谱变化。此外，它在新生儿筛查领域也有了很大的扩展，产生了针对氨基酸、有机酸、脂肪酸氧化和其他先天性代谢错误的多重检测组合。

其他应用

质谱也有与空间相关的应用，两个重要的应用是观察载人航天任务的空气质量和检查行星大气的成分。  它在行星任务中的成功使用可归因于可用于减少资源需求的空间真空。

由于其速度和灵敏度，质谱在药物发现的许多阶段也发挥了关键作用。  药物反应优化、文库产物的结构分析和文库化合物质量评估只是如何使用该技术的几个例子。

质谱法也越来越多地用于石油成分测量和碳测年的地质研究。  该技术还可用于测试水质或潜在的食品污染。

简而言之，质谱在各种临床和其他研究工作中变得非常突出。  因此，对技术的基本掌握对于理解所有可能的生产性交互是必要的。