蛋白质测序主要是依靠化学或酶消化的方法来分离多肽并检测氨基酸残基的数量和组成,这篇文章将介绍蛋白质测序的原理和实验步骤。
目前,所谓的蛋白质测序是指检测蛋白质的一级结构,其包含蛋白质中多肽链的数量。多肽和蛋白质可在许多情况下同等使用。多肽的氨基酸序列是蛋白质的生物学功能。
蛋白质分子必须经过分离纯化。几种多肽通过非共价键结合在一起,称为寡聚蛋白。比如用8 mol/L尿素或6 mol/ L盐酸胍处理四聚体-血红蛋白和二聚体-烯醇化酶。
多肽的数目可通过检测氨基酸残基的摩尔数与蛋白质分子量之间的关系来确定。
几条多肽链通过二硫键连接。在8 mol/ L尿素或6 mol/ L盐酸胍条件下,过量的[β]巯基乙醇将二硫键还原为硫醇。然后用烷基试剂保护,防止再氧化。
裂解和保护二硫键
A. 过甲酸:-CH2SO3H
B. 还原+氧化:巯基乙醇,DTT +碘乙酸,-S-CH 2-COOH
C. 亚硫酸分解:-R1-S-S-R2 + HSO3-,R1-S- + R2-S-SOH3
多肽的氨基酸分为两类:氨基末端和羧基末端。在肽链氨基酸序列分析中,N端比C端更为重要。
通常,胃蛋白酶将用于处理具有二硫键的那些多肽链。然后用二维电泳技术分离每个肽段。分析可能含有二硫键的肽段的组成和序列。然后将其与其它方法分析的肽片段进行比较,确定二硫键的位置。
辉骏生物基于高精度、高分辨率质谱设备,结合自主研发的测序技术平台,能够实现对目标蛋白氨基酸序列的精准解读。该技术可以用于解析任何纯蛋白样本,比如工具酶、突变蛋白、单克隆抗体等。
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