基因合成有以下优点：

1.专业的密码子优化技术提高了蛋白的表达量及可溶性；

2.成本效益低，通过普通PCR克隆方法构建组织特异性cDNA文库是费时费钱的；

3.基因合成获得的基因无突变、准确，普通PCR产生非预期结果的可能性大，从而影响后续实验的进行；

4.不需要依赖模板以及载体酶切位点的限制。