单细胞RNA测序与大颗粒淋巴细胞白血病T细胞的TCR分析相结合

发布时间：2022-05-31 10:26:59作者：辉骏生物-fitgene

T 细胞大颗粒淋巴细胞白血病 (T-LGLL) 是一种淋巴组织增生性疾病，通常表现为血细胞减少，通常以终末分化效应记忆细胞毒性 T 淋巴细胞 (CTL) 的克隆扩增为特征。T-LGLL可用多种免疫抑制药物（主要是环孢素）和甲氨蝶呤等淋巴毒药物治疗；JAK-STAT 信号的抑制似乎在试点试验中也有效。虽然针对 T-LGLL 细胞群的治疗是有效的，但在某些情况下，反应和缺乏反应的基础尚不清楚。特别是在没有根除 CTL 克隆的情况下，可能会出现血细胞计数的改善。

单细胞 T 细胞受体 (TCR) 测序与 RNA 测序相结合，能够以单细胞分辨率对配对的 TCRα 和 TCRβ 链进行高通量分析，以及在同一细胞中耦合全局基因表达，从而获得表征的能力稳态和疾病中的 T 细胞克隆扩增，并在疾病和治疗期间跟踪同一克隆的转录组变化。使用单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 分析的研究有助于识别肿瘤中的免疫细胞亚群、检查点抑制剂治疗和自身免疫性疾病，但此类研究尚未使用 T-LGLL 进行。

近日，美国国立卫生研究院国家心肺血液研究所血液学部的研究人员在《自然通讯》杂志上发表了题为“单细胞RNA测序与大颗粒淋巴细胞白血病T细胞的TCR分析”的文章。作者将单细胞 TCR 测序 (scTCR SEQ) 结合 scrna SEQ 应用于从 t-lgll 患者获得的 CD3 + T 细胞，以确定 T-LGLL 的免疫治疗机制。

T-LGLL 患者的 AT 细胞景观。

图：T-LGLL 患者的 AT 细胞景观

这些研究人员使用单细胞分辨率的耦合 T 细胞转录组和 TCR-seq 分析来表征在 2 期临床研究中接受单克隆抗体药物治疗的 T-LGLL 患者的 T 细胞克隆扩增和基因表达。的单细胞 TCR 和 RNA 测序 + 来自 13 名患者在单克隆抗体药物治疗前后取样研究结果证实了 T 细胞的克隆扩增，T-LGLL 中缺乏常见的 TCR 克隆型，以及来自单个细胞的配对 α 和 β 链信息。此外，我们发现 T-LGLL 细胞的特征在于细胞存活和凋亡基因程序的失调，以及 CD8 + 克隆中凋亡基因的显着下调。单克隆抗体药物治疗后凋亡基因上调，特别是在应答者中而不是在无应答者中，因此凋亡基因的基线表达水平可预测血液学反应。总之，从单细胞数据分析中得出的推论有助于理解 T-LGLL 克隆扩增和持续存在的病理生理机制。

参考

Gao S, et al. Single-cell RNA sequencing coupled to TCR profiling of large granular lymphocyte leukemia T cells. Nat Commun. 2022,13(1):1982.

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