来自西奈山伊坎医学院的研究人员与美国国立卫生研究院临床蛋白质组肿瘤分析联盟，德克萨斯大学医学博士安德森癌症中心，迈阿密大学米勒医学院的西尔维斯特综合癌症中心等合作，揭示了对癌症免疫反应的详细了解，标志着该领域的重大发展。研究结果发表在2月14日的Cell在线杂志上。

该研究利用了10种不同癌症的1,000多个肿瘤的数据，首次整合了DNA、RNA和蛋白质组学（蛋白质研究），揭示了肿瘤中免疫细胞的复杂相互作用。这些数据来自临床蛋白质组肿瘤分析联盟（CPTAC），这是美国国家癌症研究所的一个项目。

每种类型的免疫反应都与基因功能的变化有关，例如基因如何被修饰，它们发出的信息以及它们产生的蛋白质。通过提供癌症免疫反应的全面分子指纹，这项研究有望促进未来免疫治疗策略的发展。

一个关键的发现是，在通过先进的统计模型确定的七种亚型中，有五种包括来自十种不同类型癌症的肿瘤，这表明这些肿瘤之间存在共同的免疫反应。当我们在同一免疫组内的各种癌症中看到共同的免疫反应和细胞行为方式的相似模式时，它暗示某些增强免疫系统的治疗方法可以很好地用于许多类型的癌症。

这项研究的一个新方面源于1,000多个肿瘤产生的深度磷酸蛋白组学数据。这些数据使研究人员能够了解蛋白质是如何被修饰的。“通过对1,000多种泛癌肿瘤的磷酸化蛋白质组学分析，科研人员能够通过计算发现一系列关键的新型药物靶点。通过用小分子或其他手段靶向选定的激酶，可能将对免疫疗法没有反应的肿瘤转化为具有更好免疫疗法反应的肿瘤。

作为研究的一部分，应用于数字病理学图像的机器学习工具也证明了不同类型的免疫反应与某些免疫细胞的存在之间的相关性，从而增强了对肿瘤内部和周围环境的理解。

接下来，研究人员计划进一步验证他们的发现，并利用正在进行的免疫治疗临床研究的见解。这项工作旨在简化治疗反应的生物标志物小组的开发，并确定增强的治疗策略。

蛋白组/代谢组实验

❶ iTRAQ 定量蛋白质组学

❷ Label Free 实验检测服务

❸ LC-MS/MS 蛋白质谱鉴定

❹ DIA 全息扫描定量蛋白质
❺ 广泛靶向代谢组学

蛋白/核酸相互作用实验

❶ GST pull down

❷ RNA pull down

❸ DNA pull down

❹ Co-IP 免疫共沉淀

❺ TAP-MS串联亲和纯化

分子细胞生物学实验

❶ 基因调取/合成 (cDNA克隆)

❷ 荧光定量PCR (qPCR)

❸ 载体构建实验服务

❹ miRNA靶基因验证
❺ 慢病毒包装

科研产品

❶ 哺乳动物细胞表达载体

❷ 人cDNA克隆库

❸ 慢病毒表达载体

❹ 慢病毒干扰载体

抗体工程服务

❶ 单克隆抗体测序

❷ 抗体从头测序

❸ 抗体表达服务

❹ 重组抗体表达

实验试剂盒

❶ RNA pull down 试剂盒

❷ GST pull down 试剂盒

❸ COIP 试剂盒

❹ Flag 试剂盒