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免疫共沉淀(CoIP)与免疫沉淀(IP)有何区别 ?

您是否对免疫沉淀CoIP和免疫共沉淀IP之间的差异感到困惑?这两种技术表面上看起来很相似,但它们在应用和实验设置上存在分歧。免疫沉淀涉及从样品中分离靶蛋白质与其他蛋白质的混合物。它利用抗体来固定特定的蛋白质。另一方面,免疫共沉淀使研究人员能够识别和表征蛋白质-蛋白质的相互作用,使其更上一层楼。这项技术旨在从复杂的混合物中挖掘出目标蛋白及其伙伴蛋白,为它们的整合功能提供重要的见解。总之,虽然免疫沉淀分离特定的感兴趣的蛋白质,但免疫共沉淀深入研究样品内蛋白质相互作用的动态网络。


实验设计

免疫沉淀和免疫共沉淀之间的二分法植根于实验设计的细节。免疫沉淀需要明智地使用特异性抗体以从蛋白质的复杂混合物中提取目标蛋白质。最重要的抗体锁存到所需的蛋白质上,产生有趣的抗原-抗体复合物的形成,然后使其沉淀,通常利用蛋白质A/G珠或类似的技术。这一多方面的魔法在其确保目标蛋白质的纯化和浓缩以用于下游分析的能力方面是无与伦比的。


在这个复杂的硬币的另一面是免疫共沉淀。这种方法将感兴趣的蛋白质及其相互作用的伴侣一起并以一定的技巧抛到聚光灯下。为了实现这一点,抗体(当然)被部署,其全神贯注地专注于感兴趣的蛋白质。这种大胆的方法旨在捕获感兴趣的蛋白质及其灵巧的随从时,研究它们在复合物中的相互作用。这种复杂的生物学作用网络需要尖端技术,而免疫共沉淀是最有效的方法之一。


应用领域

IP免疫沉淀的科学技术是一种高度有效的方法,主要用于从复杂混合物中分离和纯化特定的感兴趣蛋白质。这种广泛使用的方法提供了大量有价值的见解蛋白质研究的不同方面,如蛋白质的结构,功能,翻译后修饰,和蛋白质-蛋白质的相互作用。通过使用免疫沉淀作为工具,研究人员可以研究特定蛋白质在给定样品中的存在和分布,以及其生化特性。


然而,对于蛋白质-蛋白质相互作用的研究,通常采用称为免疫共沉淀的更先进和复杂的方法。该技术专门设计用于鉴定和分离与靶蛋白相互作用的蛋白质,提供对复合物内蛋白质的功能关系、动力学和组成的核心见解。此外,从co-IP收集的信息对于分析信号通路、研究蛋白质复合物以及探索与蛋白质-蛋白质相互作用相关的复杂生物过程是非常宝贵的。因此,免疫共沉淀是蛋白质研究领域中的重要工具,提供了对生物过程的潜在机制和复杂性的更好的理解。


目标选择

在免疫沉淀的复杂世界中,靶蛋白的选择是决定研究成败的关键步骤。它需要科学悟性、战略思维以及对所研究蛋白质生物学功能的深刻理解相结合。通常,研究人员会仔细研究大量数据,寻找蛋白质相互作用的线索,与研究问题的相关性,以及其他特定标准,以确保分离出感兴趣的单个蛋白质。


但对知识的追求并不止于此。进入免疫共沉淀co-ip,一种将目标选择提升到一个全新的水平的技术。这种方法将焦点扩展到单个蛋白质之外,鼓励对蛋白质-蛋白质相互作用进行更广泛的研究,这些相互作用对我们理解复杂生物系统至关重要。通过捕获靶蛋白及其相互作用的伴侣,研究人员可以更深入地研究这些关系的错综复杂,并揭示构成这个非凡网络的复杂组成部分。


下游分析

IP和COIP之后可以进行各种下游分析,例如蛋白质印迹、质谱或功能测定。然而,下游分析的选择可能取决于实验的具体目标而不同。免疫沉淀之后通常是如蛋白质印迹的技术以验证靶蛋白的存在和纯度。它也可以用于蛋白质定量或检测特定的翻译后修饰。另一方面,免疫共沉淀经常与质谱等技术结合,以鉴定蛋白质复合物内的相互作用伴侣。这种方法提供了一个更广泛的观点,蛋白质相互作用,并允许复杂的组合物和动力学的表征。


总之,免疫沉淀和免疫共沉淀是蛋白质研究中有价值的技术,但它们在实验设计、应用、靶点选择和下游分析方面有所不同。免疫沉淀主要集中在特定蛋白质的分离和纯化,而免疫共沉淀的目的是捕获蛋白质复合物并研究蛋白质-蛋白质相互作用。了解这些技术之间的差异可以让研究人员根据他们的研究目标和实验需求选择最合适的方法。



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辉骏生物提供的Co-IP免疫共沉淀技术服务分为以下两种:

1. Co-IP WB,用于检测某样本中的诱饵蛋白和待测蛋白是否存在相互作用;

2. Co-IP MS,用于筛选某样本中的诱饵蛋白与哪些蛋白具有相互作用。

服务项目
服务内容结果交付实验周期客户提供
价格

Co-IP WB

(验证型)

样本中诱饵蛋白和待测蛋白的Western blot检测Western blot检测图4-5周

实验样本

诱饵蛋白的IP级抗体

待测蛋白抗体

实验信息表


点击询价


Co-IP调取诱饵蛋白及其互作蛋白

(2组:实验组、对照组)

CoIP实验报告

诱饵蛋白Western blot检测图

待测蛋白Western blot检测图

Co-IP MS

(筛选型)

样本中诱饵蛋白的Western blot检测Western blot检测图7-8周

实验样本

诱饵蛋白的IP级抗体

实验信息表



点击询价



Co-IP调取诱饵蛋白及其互作蛋白

(2组:实验组、对照组)

CoIP实验服务报告

诱饵蛋白Western blot检测图

LC-MS/MS检测及数据分析

质谱检测结果及报

告互作蛋白筛选表格

生物信息学分析结果和报告



免疫共沉淀Co-IP实验服务案例—客户文章解析


Jiang S.Y. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP.

 Cancer Research. 2019. (中科院1区,IF=13.312).


胆固醇通过APMAP抑制EGFR降解诱导前列腺癌细胞转移



研究概述

转移性前列腺癌具有很高的致命性。已有报道表明,胆固醇与前列腺癌的发展有关;前期研究发现,胆固醇可以诱导前列腺癌细胞发生上皮-间质转化(EMT),但其作用及潜在机制尚不清楚。本研究证明胆固醇介导APMAP上调,APMAP通过与EGFR竞争结合EPS15R,进而抑制EGFR降解,激活ERK1/2通路,促进前列腺癌细胞EMT;提出APMAP可能是一种关键的调节剂,为高脂肪饮食、肥胖和癌症转移之间提供了联系。


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研究路线


细胞功能实验证实胆醇诱导前列腺癌细胞EMT的发生依赖于ERK1/2的激活
RNA-seq、蛋白组学等实验筛选和验证与胆固醇有关的差异基因和蛋白,确定ERK1/2的上游凋节因子“ APMAI和“"EGFR”作为后续研究目标
APMAP基因敵除后的RNA-seq结果及其细胞实验均显示APMAP和胆固醇可能有相似的功能
APMAP和EGFR的表达关系实验表明 APMAP通过调节EGFR参与胆固醇诱导的EMT过程
免疫共沉淀Co-IP结合质谱实验找到 APMAP的互作蛋白EPS15R
免疫荧光结果显示胆固醇诱导使EPS15R和APMAP的作用增强,EPS15R与EGFR解离,进而抑制EGFR降解
临床样本分析APMAP与前列腺癌的关系




免疫共沉淀coip实验—辉骏生物高分客户文章


1. Li H.B. et al: The plant ESCRT component FREE1 shuttles to the nucleus to attenuate abscisic acid signaling. Nature Plants. 2019,IF=17.352.
【研究内容】:客户发现,作为内体蛋白分选转运复合体成分之一的FREE1基因,受到脱落酸刺激时候会发生磷酸化并移位到细胞核。客户利用酵母双杂交技术找到两个核蛋白ABF4 and ABI5会与FREE1结合,免疫共沉淀CoIP实验进一步证实了FREE与这两个蛋白的互作。后续实验表明,FREE1通过抑制ABF4、ABI5对下游基因的调控能力,参与了脱落酸信号通路。
使用相关技术:质谱鉴定、免疫共沉淀co-ip、Co-IP MS实验


2. Jiang, S. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP. Cancer Research.2019,IF= 13.312.
【研究内容】:客户利用蛋白质组学技术,筛选出胆固醇致前列腺癌发生上皮间质转变(EMT)的重要基因APMAP和EGFR。通过在前列腺癌细胞表达3*Flag-APMAP基因,并利用免疫共沉淀CoIP及质谱鉴定技术,客户发现EPS15R可与APMAP结合。进一步的研究证实,体内EPS15R-APMAP复合物通过EGFR致使细胞发生EMT。
使用相关技术:蛋白质组学、质谱鉴定、免疫共沉淀CoIP


3. Huang C.Y. et al: UBAP2L arginine methylation by PRMT1 modulates stress granule assembly. Cell Death Differ. 2020 , IF=12.067.
【研究内容】:前期研究表明UBAP2L蛋白参与应激颗粒形成。客户在这项研究中,用免疫共沉淀结合质谱等技术,发现PRMT1甲基化UBAP2L,UBAP2L蛋白并且和另外三个应激颗粒形成有关的重要蛋白有相互作用。这些蛋白复合物介导了应激颗粒的形成。
使用相关技术:coip技术服务、质谱鉴定、修饰位点鉴定



CoIP实验技术外包—辉骏服务优势

1. 近十年服务经验,服务客户众多,案例发表在Nature Cell Biology、Nature Plants、Cancer Research等知名期刊上。

2. 对蛋白互作的筛选鉴定理解深刻,擅长针对客户具体情况提出合适的方案建议。

3. 自有分子及细胞生物实验平台,能有效制定并执行最优的实验路线。

4. 自有蛋白质组学平台,对微量CoIP实验产物的质谱鉴定有十足的把控能力,对后续的生物信息分析有独到的见解。

5. 售后技术支持将一直保持到客户发表文章,确保客户安心免疫共沉淀下游实验及投稿。


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