SILAC技术研究蛋白质与DNA相互作用步骤：

（1）细胞分别用“轻”型和“重”型同位素标记后，提取蛋白质，等量混合。

（2）“轻”蛋白质与对照DNA探针进行孵育，“重”型蛋白质与目标DNA孵育，洗脱后等量混合。

（3）混合蛋白质经过胰蛋白酶切割后质谱分析，通过比较“重”型蛋白质与“轻”型蛋白质的量来分析是否是目的DNA特异性相互作用的蛋白质。