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RNA pull down

技术概述       
RNA pull down是体外研究RNA与蛋白互作的重要技术。该技术通过体外转录靶RNA的一部分或全长,用生物素标记转录产物,再与蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素磁珠结合,从而把靶RNA结合蛋白从蛋白提取液中分离出来。复合物从磁珠上洗脱下来,通过western blot实验检测特定的RNA结合蛋白是否与靶RNA结合;通过质谱仪检测,可以筛选到与靶RNA结合的蛋白。
 


技术原理  
生物素与链霉亲和素间的作用是目前已知强度最高的非共价作用;其中活化生物素可以在蛋白质交联剂的介导下,与已知的几乎所有生物大分子偶联。因此用生物素标记核酸后,利用生物素和链霉亲和素之间的亲和作用,可以纯化出各种生物大分子复合物。
       
RNA pull down实验是用生物素标记体外转录的靶RNA分子,再用链霉亲和素纯化出与靶RNA结合的蛋白复合体,洗脱得到RNA结合蛋白质。
 

技术应用

靶RNA结合蛋白的验证或筛选。
 



技术流程


服务信息


 辉骏生物:RNA pull down技术服务内容

参考文献

1.Identification of RNA-Protein Interactions Through In Vitro RNA Pull-Down Assays. Methods MolBiol 1480:99-113(2016).
       
2.The long noncoding RNA ASNR regulates degradation of Bcl-2 mRNA through its interaction with AUF1. Sci Rep 6:32189 (2016).
       
3.Silencing of the mRNA-binding protein HuR increases the sensitivity of colorectal cancer cells to ionizing radiation through upregulation of caspase-2. Cancer Lett 393:103-112(2017).


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