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成功案例

 

  从2008年开展业务以来,辉骏生物已为各地科研单位完成上万张双向凝胶电泳,数万个蛋白质的质谱鉴定。客户采用我们提供的服务数据,成功发表数十篇SCI论文和国内核心期刊论文。
 

部分客户发表SCI论文:

Jiang, S. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP. Cancer Research, 79(12):3063-3075 (2019). ( IF: 9.13)
【研究内容】:前期研究发现,胆固醇能够引起前列腺癌细胞中的APMAP和EGFR蛋白在脂筏上积累并促进细胞发生EMT, 并且APMAP通过EGFR起作用,但具体如何作用呢?在本研究中,作者利用Co-IP-MS筛选方法,试图找到APMAP的结合蛋白。当在细胞中过表达APMAP-3*FLAG后,采用flag抗体做Co-IP实验,质谱检测富集到的蛋白成分,并结合生物信息学分析,找到了与APMAP相互作用的蛋白EPS15R;经过一系列基因表达、细胞功能检测,最终验证了APMAP/EPS15R/EGFR通路,即APMAP和EPS15R复合物调控了EGFR蛋白的稳定性,进而影响前列腺癌细胞的EMT。
我们的技术服务:Co-IP-MS/MS,生物信息学分析
 

Gao C.J. et al: The plant ESCRT component FREE1 shuttles to the nucleus to attenuate abscisic acid signaling. Nature Plants, 5(5):512-524 (2019). (IF: 11.471).
【研究内容】:本研究报道了特有囊泡运输调控蛋白FREE1蛋白穿梭入核,在转录水平调控植物ABA信号的全新功能,并揭示了其作用机制。在本研究中,作者发现脱落酸(ABA)处理会导致部分FREE1蛋白被SnRK2蛋白激酶磷酸化修饰并进入细胞核,在细胞核内FREE1蛋白会与ABA信号途径的重要转录因子ABI5等互作并抑制其转录激活活性。其中,为了验证FREE1蛋白中受ABA影响的磷酸化位点,作者用ABA处理样本后,采用IP方法富集了FREE1和FREE1突变体,之后用LC-MS/MS技术检测了FREE1及其突变体的磷酸化位点。
我们的技术服务:IP-MS/MS磷酸化位点检测。

Gu C.M. et al: Discovery of the Oncogenic Parp1, a Target of bcr-abl and a Potential Therapeutic, in mir-181a/PPFIA1 Signaling Pathway. Molecular Therapy: Nucleic Acids (2019). (IF: 5.66).
【研究内容】:miR-181a在白血病特别是慢性粒细胞白血病(CML)中表达下调,并影响疾病发展、耐药性和预后,但其靶基因的分子机制尚不清楚。该文章通过基因芯片,SILAC蛋白组学等方法联合分析,发现PPFIA1miR-181a的直接靶基因。当敲低细胞中的PPFIA1后,KIT信号分子的磷酸化水平明显下调。另外,CoIP-MS实验发现,PARP1会结合PPFIA1,并通过激活核受体kappa B(NF-kB)-P65的表达而上调KIT蛋白;抑制PPFIA1PARP1能够下调c-KIT水平,抑制CML细胞生长,并延长小鼠存活期。总的来说,该研究揭示了miR-181a/PPFIA1/PARP1/NFkB-P65/KIT的分子调节轴,并提出PPFIA1PARP1可能是潜在的CML治疗靶点。
我们的技术服务:SILACCo-IP-MS/MS

Bao X.C. et al: Capturing the interactome of newly transcribed RNA. Nature Methods, 15(3): 213–220(2018).( IF: 26.919 )
【研究内容】:该研究开发了一种分离 RNA 结合蛋白的新技术——RICK(Newly Transcribed RNA interactome using click chemistry):用EU(ethynyluridine)来标记细胞内的RNA,再将EU生物素化,利用核酸标记,将新合成的RNA标记上生物素,最后通过链霉亲和素偶联的磁珠,分离得到相应被标记RNA分子和与其相结合的蛋白分子,包括非polyA RNA和新生RNA在内的一系列RNA分子及其结合蛋白。
我们的技术服务:LC-MS/MS

Zhuang Q. et al: NCoR/SMRT co-repressors cooperate with c-MYC to create an epigenetic barrier to somatic cell reprogramming. Nature Cell Biology. (2018). ( IF: 19.064 )
【研究内容】:通过分析转录抑制复合物NCoR/SMRT在不同细胞环境中的作用,发现该抑制复合物作为体细胞重编程中新的限制因素,对重编程因子诱导的相关基因表达调控起了至关重要的抑制作用,涉及的具体机制是该复合物中组蛋白去乙酰化酶HDAC3对目的基因进行了特异性组蛋白去乙酰化修饰,从而导致重编程因子无法有效地激活内源性的多能性基因。
我们的技术服务:ChIP。

Bai X.C. et al: Tyrosine kinase Fyn promotes osteoarthritis by activating the β-catenin pathway. Ann Rheum Dis, 0:1–9(2018). ( IF: 12.35 ).
【研究内容】:骨关节炎和软骨退变过程中,WNT/β-catenin被激活的机制尚未完全明确,本研究利用iTRAQ蛋白质组学技术,筛选了年轻(2月龄)和老龄(12月龄)小鼠的蛋白表达差异,并发现一种在老年软骨中强烈上调(12.47倍)的蛋白——酪氨酸激酶Fyn,后续 Western Blot实验和动物实验都证实了这一结果。为了探究Fyn促进骨关节炎发展的机制,作者将免疫沉淀(IP)与蛋白质组学分析相结合,以鉴定软骨原代细胞系ATDC5中的Fyn相互作用蛋白,并在纯化的复合物中发现了β-catenin的肽序列,表明β-catenin潜在的结合伴侣Fyn。最终证明酪氨酸激酶Fyn可以通过激活β-catenin通路促进关节炎。
我们的技术服务:iTRAQLC-MS/MS

He L.F. et al: FEN1 promotes tumor progression and confers cisplatin resistance in non-small-cell lung cancer. Molecular Oncology, 11(9):1302-1303 (2017) .( IF:5.314 ).
【研究内容】:作者发现FEN1在肺癌细胞中高表达,是碱基切除修复通路的重要组分,在维持基因组稳定性方面发挥重要作用。FEN1对肺癌细胞增殖来说很关键,抑制FEN1会导致DNA复制能力下降和DNA损伤积累,最终引发凋亡。FEN1量的改变还会影响肺癌细胞对化疗药物的响应。在小鼠实验中,FEN1抑制剂的使用也能够阻碍肺癌的发展。因此,该研究指出FEN1的有效利用可能会为肺癌靶向治疗提供帮助。
我们的技术服务:慢病毒。

Yang M. et al: Pattern of Protein Expression in Developing Wheat Grains Identified through Proteomic Analysis. Front Plant Sci, 8:962(2017) .( IF: 4.298 ).
【研究内容】:为了探索谷类作物早期发育的分子机制,作者分别收集高、低产小麦品种在三个不同发育阶段的样本,采用iTRAQ技术得到了这些样本的蛋白质组表达差异。实验共鉴定了3600个蛋白,其中130个蛋白在2个小麦品种间存在表达差异,306个蛋白随着发育阶段的不同而表现出水平变化。针对差异蛋白的生物信息学分析,进一步为其参与的分子机制研究提供了参考。
我们的技术服务:iTRAQ生物信息学分析

Identification of Nucleobindin-2 as a Potential Biomarker for Breast Cancer Metastasis Using iTRAQ-based Quantitative Proteomic Analysis. J Cancer, 8(15):3062-3069(2017) .( IF: 3.249 ).
【研究内容】:癌转移是乳腺癌发展的致命步骤,至今还没有明确的可用于诊断的乳腺癌转移标志物,本研究旨在寻找乳腺癌转移标志物及能表明患者预后的关键因子。作者收集了23对早期乳腺肿瘤及转移淋巴结样本,做了iTRAQ蛋白质组学检测,鉴定出4837个蛋白,其中643个蛋白在两类样本中存在表达差异,并发现了对乳腺癌患者来说的关键危险蛋白NUCB2,揭示NUCB2或许可以作为一个潜在的标志物来指示乳腺癌的转移和预后。
我们的技术服务:iTRAQLC-MS/MS

Zhou C.X. et al: Global iTRAQ-based proteomic profiling of Toxoplasma gondii oocysts during sporulation. J Proteomics, 148:12-19 (2016).
【研究内容】:弓形虫是医学和经济中重要的原生动物寄生虫,而其孢子形成的分子机制仍未知。为探索有关分子机制,作者对孢子形成期和非孢子形成期弓形虫卵囊的蛋白表达谱进行了分析。利用iTRAQ和2D LC-MS/MS技术共鉴定到2095个蛋白,其中有587个差异表达蛋白。GO富集和KEGG pathway分析表明,这些差异蛋白是一些与氨基酸、碳和能量代谢相关的蛋白。蛋白互作网络STRING分析,鉴定ACL、GMP合成酶、IMP脱氢酶、PARG和DHFR-TS为5个高级互作中心。另外,作者还鉴定到25个在孢子形成期卵囊中高表达的寄生虫毒性因子。考虑到卵囊在弓形虫病传播中的重要作用,这些研究结果将为寻找在卵囊感染力和生态成功方面起重要作用的蛋白提供一定参考,从而为发展更有效的疾病防预方法创造新机遇。
我们的技术服务iTRAQ生物信息学GO、pathway分析等。

Sun, H. et al: The FEN1 L209P mutation interferes with long-patch base excision repair and induces cellular transformation. Oncogene (2016).
【研究内容】:FEN1是多功能的,含特殊结构的核酸酶,它在维持人基因组的稳定性中有重要作用。人癌症样本中,检测到有FEN1突变的,这种突变显示基因组的稳定性变差和癌变倾向。然而,FEN1功能缺失与癌症易感性的关系并不清楚。在本研究中,作者发现了新的与直肠癌相关的FEN1突变,L209P。该突变缺乏FEN1的侧翼内切酶活性、外切酶活性及缺口内切酶活性,但保留了DNA结合特性。体内和体外实验表明,L209P突变子能干扰野生型FEN1的功能。且表达L209P突变的细胞,对基因损伤更敏感,从而导致细胞内基因组的不稳定和细胞转化;同时,移植L209P突变细胞的模型小鼠会长出肿瘤。这些数据表明,人癌症相关FEN1遗传改变,非常有利于癌症的发展。
我们的技术服务慢病毒载体构建及包装。

Hua, Y. et al: iTRAQ-based quantitative proteomic analysis of cultivated Pseudostellaria heterophylla and its wild-type. J Proteomics, 139:13-25 (2016).
【研究内容】:太子参是我国重要的传统中药,药效显著且药性温和,应用比较广泛,市场需求大。为探究栽培型和野生型太子参的蛋白质组的差异,作者以太子参的转录组数据(该物种暂无参考基因组)建立参考数据库,对以上两种类型的太子参的蛋白组进行了分析比较。利用iTRAQ技术共鉴定到3775个蛋白,其中差异表达的蛋白有322个。根据蛋白的GO注释、KEGG通路分析、STRING分析结果及蛋白的表达差异情况,共选择了其中71个差异表达蛋白进行qRT-PCR定量分析,证实了蛋白表达谱的准确性。分析结果表明,栽培型太子参的碳水化合物和氨基酸代谢强度比野生型弱,并发现7个参与蔗糖和氨基酸代谢调控的重要蛋白。这些结果为探索栽培型和野生型太子参的次生代谢差异及品质差异形成的蛋白机理提供了基础。
我们的技术服务iTRAQ生物信息学GO、pathway分析等。

Guo, X. et al: iTRAQ-based comparative proteomic analysis of Vero cells infected with virulent and CV777 vaccine strain-like strains of porcine epidemic diarrhea virus. J Proteomics, 130:65-75 (2016).
【研究内容】:为剖析强毒性猪流行性腹泻病毒CH/YNKM-8/2013的潜在致病机理,及阐明强毒株和CV777疫苗株样病毒株感染宿主的差异,作者对感染不同病毒的非洲绿猴肾异倍体细胞的蛋白质组进行了分析比较。利用iTRAQ技术分别在感染强毒株和CV777疫苗株样病毒株的细胞中鉴定到661和474个差异表达蛋白。常规信号通路和参与流行性腹泻病毒感染的功能网络的生物信息学分析结合后续综合研究,揭示了强毒株病毒通过下调mTOR及其下游靶蛋白4EBP1和p70S6K的活性来抑制宿主细胞的蛋白合成。另外,强毒株比CV777疫苗株样病毒株激活NF-κB通路的能力更强,从而引起更激烈的炎症级联反应。这些数据为阐述流行性腹泻病的发病机理提供了新视野,并为探索有效的治疗方法提供了参考。
我们的技术服务iTRAQ生物信息学GO、pathway分析等。

Zhai, Y et al: Activation of the TOR Signalling Pathway by Glutamine Regulates Insect Fecundity. Sci Rep, 5:10694 (2015).
【研究内容】:在响应营养信号(如氨基酸)后,TOR会积极控制细胞生长。然而,已知的能被Gln响应的特定营养物质有限。Gln是生物机体代谢过程中重要的氨基酸,由Gln合成酶(glutamine synthetase,GS)催化合成;作者的前期研究表明,Gln在体内可能调控了褐飞虱的繁殖能力。但现在仍不清楚Gln是否激活或抑制TOR信号通路。为探研Gln与TOR信号通路的相关性,作者利用DGE和iTRAQ技术对GS RNAi干扰组和正常组褐飞虱的转录组和蛋白组进行了分析比较,发现两组数据中有52个信号通路是共有的,其中包括TOR信号通路。进一步实验结果表明,Gln通过促进AKT的活性及抑制AMPK的活性来激活TOR信号通路;且TOR通过介导vitellogenin的表达来调节褐飞虱的繁殖能力。该研究首次报导Gln能在体内激活TOR途径。
我们的技术服务iTRAQ生物信息学GO、pathway分析等。

Xu, M. et al: Proteomic Analysis of Fetal Ovary Reveals That Ovarian Developmental Potential Is Greater in Meishan Pigs than in Yorkshire Pigs. PLoS One, 10(8):e0135514 (2015).
【研究内容】:为深入认识猪胎儿卵巢的发育过程及阐述梅山猪与国外猪种的胎儿卵巢发育差异,作者对妊娠期55天及90天两个发育时间点的梅山母猪和约克郡母猪的胎儿卵巢蛋白质表达谱进行了比较分析。利用2D-DIGE技术,分别在55天和90天妊娠期的猪胎儿卵巢中鉴定到1551和1400个蛋白。其中,在55天妊娠期的胎儿卵巢有27差异表达的蛋白,而在90天妊娠期的胎儿卵巢则有18个差异表达蛋白;这些差异表达的蛋白主要是一些具有酶催化活性或参与细胞死亡、应激反应等生物过程的蛋白。进一步研究发现,alpha-1-antitrypsin、actin、vimentin和PP2A能促进55天妊娠期约克郡母猪的早期卵泡形成;而低表达的热激蛋白和高表达的AFP蛋白可能促进90天妊娠期梅山猪卵泡的发育。并且,低表达的热激蛋白和高表达的AFP蛋白还能明显降低肥胖梅山猪感染生殖疾病的风险,并能促进排卵,表明这些蛋白的表达水平可能与肥胖猪的生殖能力密切相关。梅山母猪的卵巢发育能力比约克郡母猪的更大。
我们的技术服务2D-DIGEMALDI-TOF-TOF MS生物信息学GO、pathway分析等。

Guo, H.C. et al: Quantitative Proteomic Analysis of BHK-21 Cells Infected with Foot-and-Mouth Disease Virus Serotype Asia 1. PLoS One, 10(7):e0132384 (2015).
【研究内容】:为揭示口蹄疫病毒(FMDV)感染宿主细胞的分子机制,作者对FMDV 感染组BHK-21细胞和正常BHK-21细胞的定量蛋白质组学进行了分析。利用SILAC_LC-MS/MS技术共鉴定到2141个蛋白,发现在FMDV 感染组中显著上调和显著下调表达的蛋白分别有57和96个。根据蛋白表达差异显著性和(或)与双链RNA依赖的蛋白激酶R信号(PKR)通路网络的相关性,分别选了3个显著下调(VPS28、PKR及 EVI5)和3个显著上调(LYPLA1、SEC62及DARs)的蛋白进行了验证。利用RNAi对这些蛋白的功能进行研究,用Western Blot等实验来证实这些蛋白在FMDV复制中的重要功能。结果表明,FMDV可能通过改变宿主细胞中某些蛋白的表达水平,来制造利于感染的环境。
我们的技术服务SILAC,LC-MS/MS,生物信息学GO、pathway分析等。

Qiu, M. et al: Comparative proteomics analysis of Bacillus amyloliquefaciens SQR9 revealed the key proteins involved in in situ root colonization. Journal of proteome research, 13(12):5581-5591 (2014).
【研究内容】:为找到根际细菌与植物互作过程中,可能起重要作用的蛋白,作者对“根际型”和“游离型”解淀粉芽孢杆菌株SQR9的蛋白质组进行了比较。利用iTRAQ技术共鉴定到755个蛋白,“根际型”与“游离型”SQR9比,显著上调和下调的蛋白分别有78和 95个。分析发现与根部定殖(Root Colonization)密切相关的蛋白,是一些具有生物控制、解毒、生物膜形成、细胞运动、趋化性、转运和植物多糖降解作用的蛋白。对“根际型”SQR9中显著上调100倍的resE基因研究发现,破坏resE基因会延缓生物膜的形成,并降低细菌根部定殖能力。SQR9的蛋白质组数据为筛选在根际菌与植物互作中起重要作用的蛋白,提供了有价值的参考。
我们的技术服务iTRAQ生物信息学GO、pathway分析等。

Zhou, D.H. et al. Comparative proteomic analysis of different Toxoplasma gondii genotypes by two-dimensional fluorescence difference gel electrophoresis combined with mass spectrometry. Electrophoresis 35, 533-45 (2014).
【研究内容】:比较4种不同品系的弓形虫蛋白质组的差异,利用双向荧光差异凝胶电泳技术(DIGE),找到110个差异表达的蛋白质点,其中98个蛋白点被质谱鉴定出属于56种蛋白质。通过GO、KEGG分析,结果表明这些差异蛋白参与生物调控、代谢、应激反应、抗氧化等过程和糖酵解/糖异生途径。
我们的技术服务:荧光差异双向电泳技术DIGE)、MALDI-TOF/TOF质谱鉴定、生物信息学分析(GO、KEGG分析)等。

 
Zhou, J. et al. Characterization and Proteome Analysis of Inosine 5-Monophosphate Dehydrogenase in Epidemic Streptococcus suis Serotype 2. Curr Microbiol (2014).
【研究内容】:Ⅱ型猪链球菌是比较常见的人畜共患的病原体,近来发现一种肌苷5-磷酸脱氢酶缺失的Ⅱ型猪链球菌的致病力降低。为了研究其致病力降低机理,通过蛋白质组学的实验技术,将缺失型和野生型Ⅱ型猪链球菌进行蛋白质组的差异比较,发现并鉴定出缺失型菌株中磷酸丙糖异构酶(TPI)、GAPDH表达降低。
我们的技术服务:蛋白质组学实验技术,包括蛋白质提取纯化、MALDI-TOF/TOF质谱鉴定等。
 

Zhang, F. et al. Up-regulation of protein tyrosine nitration in methamphetamine-induced neurotoxicity through DDAH/ADMA/NOS pathway. Neurochem Int 62, 1055-64 (2013).
【研究内容】:急性甲基安非他明(METH)处理的大鼠大脑的DDAH1的表达量提高,暗示蛋白质酪氨酸硝化的提高是通过DDAH/ADMA/NOS通路介导的。用METH处理大鼠和PC12细胞后,利用稳定同位素标记(SILAC)技术和其他蛋白质组学实验技术分析,发现METH激活DDAH/ADMA/NOS通路,27种蛋白质表达量提高。生物信息学分析显示这些蛋白质是激活Cdk5、细胞骨架结构、核糖体功能的重要因子。
我们的技术服务:蛋白质组学实验技术,包括稳定同位素标记(SILAC)、质谱鉴定、生物信息学分析等。

 
Zhou, D.H. et al. Changes in the proteomic profiles of mouse brain after infection with cyst-forming Toxoplasma gondii. Parasit Vectors 6, 96 (2013).
【研究内容】:研究弓形虫感染小鼠后大脑蛋白质的应答。弓形虫感染小鼠后,利用蛋白质实验技术,发现60个蛋白点有表达差异,鉴定出45种蛋白与感染后应答有关。经过GO分析,发现这45种蛋白质参与代谢、细胞结构、信号转导、免疫应答等过程。
我们的技术服务:蛋白质组学实验技术,包括蛋白质提取纯化、MALDI-TOF/TOF质谱鉴定、生物信息学分析(GO分析)等。
 

Wu, Q. et al. Transcriptional engineering of Escherichia coli K4 for fructosylated chondroitin production. Biotechnology progress 29, 1140-1149 (2013).
【研究内容】:研究大肠杆菌K4的荚膜多糖合成的相关蛋白。过表达SlyA基因,使得大肠杆菌K4的荚膜多糖高表达,利用同位素相对标记与绝对定量(iTRAQ)技术,发现77种蛋白表达量提高、143种蛋白表达量降低。KEGG分析表明此菌株的糖酵解、TCA循环减弱,而与荚膜多糖合成有关的蛋白质表达水平上升。
我们的技术服务:同位素相对标记与绝对定量技术iTRAQ)、RPLC-MS质谱鉴定、生物信息学分析等。

 
Ye, Y. et al. Quantitative proteomics by amino acid labeling in foot-and-mouth disease virus (FMDV)-infected cells. J Proteome Res 12, 363-77 (2013).
【研究内容】:研究口蹄疫病毒感染IBRS-2细胞的相关机制。利用稳定同位素标记(SILAC)技术标记细胞,鉴定出感染病毒后的细胞有1260种蛋白质存在差异,而病毒有2种蛋白质存在变化。然后对这些蛋白质进行生物信息学分析,发现它们参与内溶酶体蛋白酶系统、细胞周期、细胞生长和繁殖、免疫细胞迁移等过程。
我们的技术服务SILAC标记测试、蛋白质提取纯化及酶切、液相分离和收集多肽组分、LTQ-Obitrap液质联用、蛋白质鉴定和定量比较、生物信息学分析等。
 

Qiu, N., Liu, W., Ma, M., Zhao, L. & Li, Y. Differences between fertilized and unfertilized chicken egg white proteins revealed by 2-dimensional gel electrophoresis-based proteomic analysis. Poult Sci 92, 782-6 (2013).
【研究内容】:比较受精和未受精的鸡蛋的白蛋白差异,采用蛋白质组学实验技术,发现2种鸡蛋内存在丰度相差10倍的蛋白质,它们包括1种卵白蛋白及其相关的6种蛋白Y,这些蛋白质在鸡胚早期发育中可能起着重要作用。
我们的技术服务:蛋白质组学实验技术,包括蛋白质提取纯化、MALDI-TOF/TOF质谱鉴定等。

 
Sun, H. et al. Differences in grain ultrastructure, phytochemical and proteomic profiles between the two contrasting grain Cd-accumulation barley genotypes. PLoS One 8, e79158 (2013).
【研究内容】:对高积累和低积累重金属镉的大麦在超显微结构、植物化学和蛋白质组进行差异分析。采用蛋白质组学实验技术,结果表明高积累镉的大麦-浙农8有17种蛋白表达量比低积累的W6nk2高,其中包括z型丝氨酸蛋白酶抑制、丝氨酸蛋白酶抑制Z7和α-淀粉酶/胰蛋白酶抑制剂、碳水化合物代谢、蛋白质合成和信号转导相关蛋白;浙农8有12种蛋白比W6nk2表达量低,其中包括大麦胰蛋白酶抑制剂氯仿/甲醇可溶性蛋白、胰蛋白酶抑制剂、脱氢抗坏血酸还原酶(DHAR)和一些抗病毒相关的蛋白质。
我们的技术服务:蛋白质抽提、纯化分离、定量比较,MALDI-TOF/TOF质谱鉴定等。
 

Liu, H. et al. Heat stress-induced response of the proteomes of leaves from Salvia splendens Vista and King. Proteome Sci 11, 25 (2013).
【研究内容】:将一串红vitas(耐热)和king(热敏)置于热应激环境中,对叶片蛋白质提取纯化,通过蛋白质组学实验,鉴定出33种与耐热有关的蛋白质。通过GO分析,大部分蛋白质参与光合作用、代谢、蛋白质加工、应激应答。
我们的技术服务:蛋白质组学实验,包括蛋白质提取纯化、质谱鉴定、生物信息学分析(GO分析)等。

 
Liu, Y., Qiu, N. & Ma, M. Comparative proteomic analysis of hen egg white proteins during early phase of embryonic development by combinatorial peptide ligand library and matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight. Poult Sci 92, 1897-904 (2013).
【研究内容】:鉴定鸡蛋的白蛋白在鸡胚胎发育过程中的变化及潜在的生物学功能。分别取发育0天和7天的胚胎白蛋白,进行蛋白质组学实验,发现54种蛋白点具有显著差异,19个蛋白点与胚胎发育有关。许多前体在发育7天的胚胎内表达量升高,包括ovoinhibitor前体、clusterin前体、载脂蛋白D前体、胞外脂肪酸结合蛋白前体。
我们的技术服务:蛋白质组学实验技术,包括蛋白质提取纯化、MALDI-TOF/TOF质谱鉴定等。
 

Li, Y. et al. Production of biomass and lipid by the microalgae Chlorella protothecoides with heterotrophic-Cu(II) stressed (HCuS) coupling cultivation. Bioresour Technol 148, 283-92 (2013).
【研究内容】:利用HCuS方法可以提高小球藻的生物产量和脂质产量,然后通过蛋白质组学实验技术,发现30种差异表达的蛋白质与产量提高有关。通过GO分析这些蛋白,发现它们参与碳水化合物代谢、固碳、TCA 循环、脂质代谢、蛋白质的生物合成、ATP 和 RNA 生物合成、核苷酸代谢和活性氧的清除。
我们的技术服务:蛋白质组学实验技术,包括蛋白分离和差异比较、MALDI-TOF/TOF质谱鉴定、生物信息学分析(GO分析)等。

 
Lan, T.Q., Wei, D., Yang, S.T. & Liu, X. Enhanced cellulase production by Trichoderma viride in a rotating fibrous bed bioreactor. Bioresour Technol 133, 175-82 (2013).
【研究内容】:在纤维床生物反应器中提高绿色木霉的纤维素酶产量。绿色木霉分别游离培养于搅拌式反应器 (STR)和固定培养于旋转纤维床生物反应器 (RFBB),结果RFBB中纤维素酶产量比STR高。然后通过蛋白质组学实验技术比较两者的发酵液中的蛋白质差异,鉴定出24种差异蛋白。质谱分析结果数据表明糖水解酶CBH II和葡聚糖酶EG II在RFBB中高表达,而CBH I和 EG IV在STR中高表达。
我们的技术服务:蛋白质组学实验技术,包括蛋白质提取纯化、MALDI-TOF/TOF质谱鉴定等。
 

Han, P. et al. Transcript and Protein Profiling Analysis of the Destruxin A-Induced Response in Larvae of Plutella xylostella. PLoS One 8, e60771 (2013).
【研究内容】:研究腐败菌素A(dtx A)对昆虫的毒性机理。小菜蛾幼虫被注入dtx A后,通过数字基因(DGE)和蛋白质组学实验技术,发现1584种基因和42种蛋白参与dtx A的毒害过程。生物信息学分析结果表明这些蛋白包括以下种类:生长和发育相关的蛋白、代谢相关蛋白质、细胞骨架蛋白、毒性反应相关蛋白。
我们的技术服务:蛋白质组学实验技术,包括MALDI-TOF/TOF质谱、生物信息学(GO聚类、KEGG)分析等。

 
Dai, H. et al. Comparative proteomic analysis of aluminum tolerance in Tibetan wild and cultivated barleys. PLoS One 8, e63428 (2013).
【研究内容】:研究野生型西藏大麦对酸性土壤中金属铝的抗性机理。将铝抗性、铝敏感的野生型西藏大麦和铝抗性品系Dayton一起进行铝胁迫处理,通过蛋白质组学实验技术,比较这三者的蛋白表达差异,发现35种大麦铝抗性相关的蛋白质。根据生物信息学分析,这些蛋白质参与代谢、能量、细胞生长/分裂、蛋白质生物合成、蛋白质定位/存储、信号转导、疾病或防御等。
我们的技术服务:蛋白质组学实验技术,包括蛋白提取分离、定量比较、蛋白鉴定、生物信息学分析等。
 

Cao, H. et al. Identification of up-regulated proteins potentially involved in the antagonism mechanism of Bacillus amyloliquefaciens G1. Antonie Van Leeuwenhoek 103, 1395-404 (2013).
【研究内容】:研究Bacillus amyloliquefaciens菌株G1的抗菌机制,对具有抗菌作用的B. amyloliquefaciens菌株G1和无抗菌作用的B. amyloliquefaciens菌株进行蛋白质差异对比,发现并鉴定35种蛋白质在G1菌株中的表达量上升。通过KEGG分析,发现高水平的能量代谢、生物合成、抗逆性在G1的抗菌机制中起着重要作用。
我们的技术服务:蛋白质组学技术,包括MALDI-TOF/TOF质谱鉴定、生物信息学分析(KEGG分析)。

 
Qiu, N. et al. Proteomic analysis of egg white proteins during the early phase of embryonic development. J Proteomics 75, 1895-905 (2012).
【研究内容】:研究鸡胚发育第一星期内的总体白蛋白的变化以期探明鸡蛋的白蛋白生物学功能。采用蛋白质组学实验技术,发现胚胎发育前后有50个蛋白点(属于8种蛋白质)存在显著丰度变化。数据分析显示这些蛋白质包括卵白蛋白、鸡蛋清、前列腺素D2合成酶、溶菌酶C、卵清蛋白相关蛋白Y等。
我们的技术服务:蛋白质组学实验技术,包括蛋白分离、纯化、定量比较和蛋白鉴定等。
 

Li, Y. et al. Proteomic analysis on N, N'-dinitrosopiperazine-mediated metastasis of nasopharyngeal carcinoma 6-10B cells. BMC Biochem 13, 25 (2012).
【研究内容】:研究鼻咽癌细胞被二亚硝基哌嗪(DNP)处理后的代谢差异。对DNP处理后的6-10B细胞进行稳定同位素标记(SILAC),找到371种显著差异表达的蛋白质。GO分析结果显示DNP可能调控蛋白质合成、细胞迁移、脂质代谢、分子运输、细胞生长和繁殖。
我们的技术服务:稳定同位素标记(SILAC)、LTQ-Obitrap液质联用、蛋白质鉴定、生物信息学分析。


Fan, H. et al. Quantitative proteomics using stable isotope labeling with amino acids in cell culture reveals protein and pathway regulation in porcine circovirus type 2 infected PK-15 cells. J Proteome Res 11, 995-1008 (2012).
【研究内容】:研究Ⅱ型猪圆环病毒(PCV2)感染PK-15细胞的发病机制和相互作用。利用稳定同位素标记(SILAC)技术标记细胞,鉴定了1341种蛋白质,找到PCV2感染PK-15细胞前后具有显著表达差异的163种蛋白质。生物信息学分析显示这些蛋白质参与底物运输、细胞骨架变化和应激反应。
我们的技术服务SILAC技术标记效率测试、蛋白质提取纯化酶切、LC-MS/MS (液相色谱-质谱联用)、质谱数据分析、生物信息学分析等。
 

Zhou, D.H. et al. Modulation of mouse macrophage proteome induced by Toxoplasma gondii tachyzoites in vivo. Parasitol Res 109, 1637-46 (2011).
【研究内容】:研究弓形虫感染小鼠巨噬细胞的相关蛋白质。弓形虫感染小鼠细胞后,利用双向电泳及质谱,鉴定出60个蛋白质点丰度有差异,38种蛋白(对应于52个蛋白质点)与感染过程有关。GO分析结果表明这些蛋白质主要参与代谢、细胞结构、蛋白质命运和免疫应答等。
我们的技术服务:蛋白质组学技术,包括蛋白质提取纯化、MALDI-TOF/TOF质谱鉴定、生物信息学分析等。

 
Li, G. et al. Protein expression profiling in the zebrafish (Danio rerio) embryos exposed to the microcystin-LR. Proteomics 11, 2003-18 (2011).
【研究内容】:研究微囊藻毒素LR(MCLR)处理前后的斑马鱼胚胎的蛋白质表达差异以期发现MCLR的毒性机理。利用蛋白质组学实验技术,发现MCLR处理前后的斑马鱼胚胎有75个蛋白点(属于40种蛋白质)存在表达差异。生物信息学分析显示这些蛋白质参与氧化应激、能量代谢和细胞骨架组装的过程。
我们的技术服务:蛋白质组学实验技术,包括蛋白分离、定量比较、蛋白质质谱鉴定、生物信息学分析等。
 

Hong, Y. & Xu, G.X. Proteome changes during bone mesenchymal stem cell differentiation into photoreceptor-like cells in vitro. Int J Ophthalmol 4, 466-73 (2011).
【研究内容】:研究骨髓间充质干细胞(BMSC)在分化为光感受器细胞样细胞过程中的蛋白质组的变化。对BMSC及其分化的光感受器细胞样细胞进行荧光差异双向电泳(DIGE),发现有32种蛋白质有差异。
我们的技术服务:荧光差异双向电泳(DIGE)、蛋白质提取纯化、质谱鉴定蛋白质。

 
Dong, H. et al. Roles of the spiA gene from Salmonella enteritidis in biofilm formation and virulence. Microbiology 157, 1798-805 (2011).
【研究内容】:研究spiA基因在肠炎沙门氏菌的生物膜构成和毒力形成的作用。比较spiA基因突变菌株和野生型菌株在形态、生长曲线、侵入上皮细胞特性和生物膜的特性等方面的异同,确定spiA参与到沙门氏菌的生物膜和毒力的形成。
我们的技术服务: 蛋白质组学技术,包括蛋白质提取纯化、质谱鉴定蛋白质等。
 

Song, C., Zeng, F., Feibo, W., Ma, W. & Zhang, G. Proteomic analysis of nitrogen stress-responsive proteins in two rice cultivars differing in N utilization efficiency. Journal of Integrated Omics 1, 78-87 (2010).
【研究内容】:研究2种水稻品系在氮胁迫中蛋白质组的变化。正常氮素营养液和无氮素营养液培养水稻幼苗,提取叶分蛋白质,采用蛋白质组学技术,分别找到12、36种蛋白在2种水稻品系的氮胁迫中起作用,鉴定出31种蛋白质,其中包括6种应激诱导蛋白。
我们的技术服务:蛋白质组学技术,包括叶片蛋白质提取纯化、MALDI-TOF/TOF质谱鉴定蛋白质等。

 
Bah, A.M. et al. Comparative proteomic analysis of Typha angustifolia leaf under chromium, cadmium and lead stress. J Hazard Mater 184, 191-203 (2010).
【研究内容】:研究90日龄和130日龄的狭叶香蒲分别对重金属铬、镉和铅的应答。重金属处理植株后,使用蛋白质组学实验技术来比较这2种日龄的狭叶香蒲叶片的蛋白质的差异变化,找到并鉴定26种蛋白质与狭叶香蒲中重金属铬、镉和铅反应相关。经过质谱数据分析,发现26种蛋白质包括铬诱导表达的ATP 合成酶、RuBisCO的小亚基、粪卟啉原III氧化酶、镉诱导的RuBisCO大亚基、改进的RuBisCO活化酶。
我们的技术服务:蛋白质组学实验技术,包括蛋白分离、定量比较、蛋白质质谱鉴定等。

Fang, S., Zeng, F. & Guo, Q. Comparative proteomics analysis of cytokeratin and involucrin expression in lesions from patients with systemic lupus erythematosus. Acta Biochim Biophys Sin (Shanghai) 40, 989-95 (2008).
【研究内容】:研究系统性红斑狼疮病人损伤部位中细胞角蛋白和膜蛋白的表达和分布情况。利用蛋白质组学技术和免疫组化实验,分析系统性红斑狼疮病人损伤组织和正常对照组的蛋白表达差异,发现角蛋白1(K1)/K10和新合成的K6/K16在病人


Xi, L. et al. Differentially expressed proteins of pathogenic Penicillium marneffei in yeast and mycelial phases. J Med Microbiol 56, 298-304 (2007).
【研究内容】:马尔尼菲青霉菌存在温度双相性开关,即在25℃生长为丝状真菌,而在37℃生长为单核酵母细胞。为了研究马尔尼菲青霉菌温度双相性的机制,利用荧光差异双向电泳技术(DIGE),对两种状态的真菌细胞进行蛋白质组差异比较,发现500个蛋白点存在表达差异,其中26种蛋白质在酵母细胞形态中表达上升,2种蛋白质在此形态中表达下降。生物信息学分析表明这些蛋白质属于热休克蛋白家族、过氧化氢酶家族、乙醛酸支路的酶、氨基酸代谢相关蛋白、能量代谢相关蛋白。
我们的技术服务:荧光差异双向电泳技术(DIGE)、MALDI-TOF质谱鉴定、生物信息学数据分析等。


Fu, H. et al. Mitochondrial proteomic analysis and characterization of the intracellular mechanisms of bis(7)-tacrine in protecting against glutamate-induced excitotoxicity in primary cultured neurons. J Proteome Res 6, 2435-46 (2007).
【研究内容】:研究线粒体蛋白质在谷氨酸诱导的兴奋性中毒所起的作用,并研究双(7)他克林的保护作用。通过荧光差异双向电泳技术(DIGE),比较谷氨酸处理组、对照组的线粒体蛋白质组的差异,发现29种蛋白质有明显的表达差异。然后对谷氨酸处理组加入双(7)他克林,与原谷氨酸处理组对比,发现29种蛋白质中有22种蛋白可以获得回复。生物信息学分析表明这些差异表达蛋白质大部分参与能量代谢、氧化应激和凋亡过程。
我们的技术服务:蛋白质提取纯化、荧光差异双向电泳技术(DIGE)、蛋白斑点差异分析、蛋白质质谱鉴定、生物信息学数据分析等。


Qiu, M., Z. Xu, X. Li, Q. Li, N. Zhang, Q. Shen and R. Zhang (2014). "Comparative Proteomics Analysis of Bacillus amyloliquefaciens SQR9 Revealed the Key Proteins Involved in in Situ Root Colonization." J Proteome Res 13(12): 5581-5591.
【研究内容】:主要研究解淀粉芽孢杆菌SQR9与植物根部定殖相关的关键蛋白。取游离的SQR9菌株和植物根部定殖后的SQR9菌株,采用iTRAQ的技术,比较两者的蛋白质组差异,鉴定到755种蛋白,在定殖菌株中有78种蛋白上调、95种蛋白下调。GO分析发现这些差异蛋白涉及生物控制、解毒、生物膜形成、细胞迁移、趋化性、运输、植物多糖降解等等。ResE蛋白在定殖菌株中的表达量是游离菌株的100倍,当破坏resE基因时,延迟生物膜的形成、降低根部定殖能力。
我们的技术服务:iTRAQ技术,包括蛋白质提取纯化、标记物标记多肽、二维液相色谱(LC/MS-MS)及质谱鉴定、生物信息学分析(GO分析)等

 

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