科研服务

Research Service

circRNA pull down

circRNA pull down是研究circRNA与蛋白相互作用的技术。

 

circRNA pull down技术原理

目前,circRNA pull down技术绝大部分是基于接口序列设计探针捕获circRNA及其结合蛋白。由于受限于接口处序列特征,很多circRNA无法设计出理想的探针,最终导致实验失败。 我公司开发了一种新型的circRNA pull down方法,通过构建circRNA过表达载体,使circRNA连上一段16nt的短RNA序列标签(命名为F2),该标签与其特异性配体具有很强的亲和力,因此可利用该系统高效调取靶RNA序列及其结合蛋白。最终通过western blotLC-MS/MS实验检测洗脱液中靶RNA的潜在结合蛋白,还可通过qPCR实验检测能够结合靶circRNA的miRNA。

circRNA pull down技术实验流程

circRNA pull down技术流程.png

辉骏生物技术优势

1. 由于F2标签是跨接口设计,只有当形成circRNA时才能保证F2标签的完整性,因此可以有效去除线性基因的背景干扰;

2. F2与其特异性配体的高亲和力,保证了该系统能够非常高效的调取circRNA及其结合蛋白,并且捕获特异性更强。

2. 不受限于circRNA接口处序列,适用范围更广。

3. circRNA pull down结合质谱的方法能够高通量的筛选与靶circRNA结合的蛋白。

 

circRNA pull down应用范围

★靶circRNA结合蛋白的验证或筛选;

靶circRNA结合miRNA的验证。

 

circRNA pull down服务信息

项目名称

客户提供

结果交付

实验周期

 




circRNA pull down WB

细胞样本
circRNA基因模板
待测蛋白抗体
实验信息表(靶circRNA序列,待测蛋白信息,细胞培养信息等)

1、circRNA表达载体
2、circRNA水平检测的qPCR结果
3、circRNA富集检测的qPCR结果
4、待测蛋白WB检测图
5、结果整理图
6、实验报告

 



9-10周

circRNA pull down MScircRNA基因模板
细胞样本
实验信息表(靶circRNA序列,细胞培养信息等)



1、
circRNA表达载体
2、circRNA水平检测的qPCR结果
3、circRNA富集检测的qPCR结果
4、质谱检测结果
5、生物信息学分析结果
6、实验报告


10-11
circRNA pull down qPCRcircRNA基因模板
细胞样本
实验信息表(靶circRNA序列,待验证的miRNA信息,细胞培养信息等)

1、circRNA表达载体
2、circRNA水平检测的qPCR结果
3、circRNA富集检测的qPCR结果
4、待测miRNA检测的qPCR结果
5、实验报告

9-10周


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